Protein–RNA interactions for Protein: P26339

Chga, Chromogranin-A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChgaP26339 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ChgaP26339 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ChgaP26339 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ChgaP26339 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ChgaP26339 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
ChgaP26339 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ChgaP26339 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ChgaP26339 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ChgaP26339 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ChgaP26339 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ChgaP26339 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ChgaP26339 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ChgaP26339 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ChgaP26339 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ChgaP26339 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ChgaP26339 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ChgaP26339 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ChgaP26339 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ChgaP26339 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ChgaP26339 Gm15968-201ENSMUST00000119342 1168 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
ChgaP26339 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ChgaP26339 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ChgaP26339 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ChgaP26339 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ChgaP26339 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ChgaP26339 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ChgaP26339 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ChgaP26339 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ChgaP26339 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ChgaP26339 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ChgaP26339 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ChgaP26339 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ChgaP26339 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ChgaP26339 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ChgaP26339 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ChgaP26339 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ChgaP26339 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ChgaP26339 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ChgaP26339 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ChgaP26339 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ChgaP26339 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ChgaP26339 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ChgaP26339 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ChgaP26339 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ChgaP26339 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ChgaP26339 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ChgaP26339 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ChgaP26339 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ChgaP26339 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ChgaP26339 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ChgaP26339 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ChgaP26339 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ChgaP26339 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ChgaP26339 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ChgaP26339 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ChgaP26339 Rpf2-206ENSMUST00000183309 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ChgaP26339 Gm27227-201ENSMUST00000183413 633 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ChgaP26339 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ChgaP26339 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ChgaP26339 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ChgaP26339 Gm43868-201ENSMUST00000205187 2114 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ChgaP26339 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ChgaP26339 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ChgaP26339 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ChgaP26339 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ChgaP26339 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ChgaP26339 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ChgaP26339 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ChgaP26339 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ChgaP26339 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ChgaP26339 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ChgaP26339 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ChgaP26339 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ChgaP26339 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ChgaP26339 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ChgaP26339 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ChgaP26339 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ChgaP26339 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ChgaP26339 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ChgaP26339 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ChgaP26339 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ChgaP26339 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ChgaP26339 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ChgaP26339 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ChgaP26339 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ChgaP26339 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ChgaP26339 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ChgaP26339 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ChgaP26339 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ChgaP26339 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ChgaP26339 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ChgaP26339 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ChgaP26339 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ChgaP26339 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ChgaP26339 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ChgaP26339 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ChgaP26339 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ChgaP26339 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ChgaP26339 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ChgaP26339 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms