Protein–RNA interactions for Protein: P23298

Prkch, Protein kinase C eta type, mousemouse

Predictions only

Length 683 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkchP23298 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
PrkchP23298 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PrkchP23298 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PrkchP23298 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PrkchP23298 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PrkchP23298 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PrkchP23298 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PrkchP23298 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PrkchP23298 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PrkchP23298 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PrkchP23298 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PrkchP23298 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PrkchP23298 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PrkchP23298 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PrkchP23298 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PrkchP23298 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PrkchP23298 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PrkchP23298 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PrkchP23298 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PrkchP23298 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PrkchP23298 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PrkchP23298 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PrkchP23298 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PrkchP23298 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PrkchP23298 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PrkchP23298 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PrkchP23298 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PrkchP23298 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
PrkchP23298 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
PrkchP23298 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PrkchP23298 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PrkchP23298 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PrkchP23298 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PrkchP23298 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PrkchP23298 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PrkchP23298 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PrkchP23298 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PrkchP23298 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PrkchP23298 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PrkchP23298 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PrkchP23298 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PrkchP23298 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PrkchP23298 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
PrkchP23298 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PrkchP23298 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PrkchP23298 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PrkchP23298 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PrkchP23298 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PrkchP23298 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PrkchP23298 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
PrkchP23298 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PrkchP23298 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PrkchP23298 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
PrkchP23298 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
PrkchP23298 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PrkchP23298 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PrkchP23298 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PrkchP23298 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PrkchP23298 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PrkchP23298 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PrkchP23298 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PrkchP23298 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PrkchP23298 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PrkchP23298 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PrkchP23298 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PrkchP23298 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
PrkchP23298 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PrkchP23298 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
PrkchP23298 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
PrkchP23298 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PrkchP23298 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PrkchP23298 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
PrkchP23298 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
PrkchP23298 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
PrkchP23298 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PrkchP23298 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PrkchP23298 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
PrkchP23298 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
PrkchP23298 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
PrkchP23298 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
PrkchP23298 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
PrkchP23298 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PrkchP23298 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PrkchP23298 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PrkchP23298 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
PrkchP23298 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PrkchP23298 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PrkchP23298 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PrkchP23298 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PrkchP23298 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PrkchP23298 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PrkchP23298 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PrkchP23298 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PrkchP23298 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PrkchP23298 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PrkchP23298 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PrkchP23298 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PrkchP23298 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PrkchP23298 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PrkchP23298 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.9 ms