Protein–RNA interactions for Protein: P21952

Pou3f1, POU domain, class 3, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou3f1P21952 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pou3f1P21952 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pou3f1P21952 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pou3f1P21952 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pou3f1P21952 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pou3f1P21952 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pou3f1P21952 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Pou3f1P21952 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Pou3f1P21952 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pou3f1P21952 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Pou3f1P21952 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pou3f1P21952 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Pou3f1P21952 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Pou3f1P21952 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Pou3f1P21952 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Pou3f1P21952 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pou3f1P21952 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pou3f1P21952 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pou3f1P21952 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pou3f1P21952 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pou3f1P21952 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pou3f1P21952 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Pou3f1P21952 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pou3f1P21952 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Pou3f1P21952 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pou3f1P21952 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pou3f1P21952 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Pou3f1P21952 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Pou3f1P21952 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pou3f1P21952 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pou3f1P21952 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pou3f1P21952 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pou3f1P21952 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pou3f1P21952 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pou3f1P21952 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pou3f1P21952 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pou3f1P21952 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pou3f1P21952 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Pou3f1P21952 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pou3f1P21952 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pou3f1P21952 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pou3f1P21952 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pou3f1P21952 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Pou3f1P21952 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pou3f1P21952 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pou3f1P21952 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pou3f1P21952 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pou3f1P21952 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pou3f1P21952 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pou3f1P21952 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pou3f1P21952 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pou3f1P21952 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pou3f1P21952 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pou3f1P21952 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pou3f1P21952 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pou3f1P21952 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pou3f1P21952 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pou3f1P21952 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pou3f1P21952 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pou3f1P21952 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pou3f1P21952 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pou3f1P21952 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pou3f1P21952 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Pou3f1P21952 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pou3f1P21952 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pou3f1P21952 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pou3f1P21952 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pou3f1P21952 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pou3f1P21952 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pou3f1P21952 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Pou3f1P21952 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pou3f1P21952 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pou3f1P21952 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pou3f1P21952 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pou3f1P21952 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pou3f1P21952 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pou3f1P21952 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pou3f1P21952 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pou3f1P21952 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pou3f1P21952 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pou3f1P21952 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pou3f1P21952 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pou3f1P21952 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pou3f1P21952 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pou3f1P21952 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pou3f1P21952 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Pou3f1P21952 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pou3f1P21952 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pou3f1P21952 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pou3f1P21952 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pou3f1P21952 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pou3f1P21952 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pou3f1P21952 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pou3f1P21952 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pou3f1P21952 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pou3f1P21952 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pou3f1P21952 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pou3f1P21952 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pou3f1P21952 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pou3f1P21952 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms