Protein–RNA interactions for Protein: P20444

Prkca, Protein kinase C alpha type, mousemouse

Predictions only

Length 672 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcaP20444 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
PrkcaP20444 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
PrkcaP20444 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
PrkcaP20444 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
PrkcaP20444 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PrkcaP20444 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PrkcaP20444 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
PrkcaP20444 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PrkcaP20444 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
PrkcaP20444 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PrkcaP20444 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PrkcaP20444 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PrkcaP20444 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PrkcaP20444 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PrkcaP20444 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
PrkcaP20444 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PrkcaP20444 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PrkcaP20444 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
PrkcaP20444 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PrkcaP20444 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
PrkcaP20444 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PrkcaP20444 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
PrkcaP20444 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
PrkcaP20444 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
PrkcaP20444 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PrkcaP20444 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PrkcaP20444 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PrkcaP20444 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PrkcaP20444 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PrkcaP20444 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PrkcaP20444 Gm40377-201ENSMUST00000204604 2015 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
PrkcaP20444 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PrkcaP20444 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PrkcaP20444 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PrkcaP20444 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PrkcaP20444 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PrkcaP20444 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PrkcaP20444 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
PrkcaP20444 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
PrkcaP20444 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PrkcaP20444 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PrkcaP20444 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
PrkcaP20444 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
PrkcaP20444 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
PrkcaP20444 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
PrkcaP20444 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
PrkcaP20444 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PrkcaP20444 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PrkcaP20444 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
PrkcaP20444 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
PrkcaP20444 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PrkcaP20444 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
PrkcaP20444 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PrkcaP20444 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PrkcaP20444 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PrkcaP20444 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PrkcaP20444 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PrkcaP20444 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PrkcaP20444 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PrkcaP20444 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
PrkcaP20444 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PrkcaP20444 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PrkcaP20444 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
PrkcaP20444 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PrkcaP20444 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PrkcaP20444 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PrkcaP20444 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
PrkcaP20444 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
PrkcaP20444 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PrkcaP20444 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PrkcaP20444 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PrkcaP20444 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
PrkcaP20444 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PrkcaP20444 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PrkcaP20444 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
PrkcaP20444 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
PrkcaP20444 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PrkcaP20444 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PrkcaP20444 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PrkcaP20444 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
PrkcaP20444 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
PrkcaP20444 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
PrkcaP20444 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
PrkcaP20444 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PrkcaP20444 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
PrkcaP20444 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
PrkcaP20444 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
PrkcaP20444 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
PrkcaP20444 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PrkcaP20444 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
PrkcaP20444 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PrkcaP20444 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
PrkcaP20444 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
PrkcaP20444 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
PrkcaP20444 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PrkcaP20444 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PrkcaP20444 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
PrkcaP20444 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PrkcaP20444 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
PrkcaP20444 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.8 ms