Protein–RNA interactions for Protein: P20033

Pdgfa, Platelet-derived growth factor subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfaP20033 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PdgfaP20033 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PdgfaP20033 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PdgfaP20033 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PdgfaP20033 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PdgfaP20033 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
PdgfaP20033 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
PdgfaP20033 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
PdgfaP20033 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PdgfaP20033 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PdgfaP20033 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PdgfaP20033 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PdgfaP20033 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PdgfaP20033 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PdgfaP20033 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PdgfaP20033 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PdgfaP20033 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PdgfaP20033 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PdgfaP20033 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PdgfaP20033 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PdgfaP20033 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PdgfaP20033 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PdgfaP20033 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PdgfaP20033 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
PdgfaP20033 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PdgfaP20033 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
PdgfaP20033 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PdgfaP20033 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
PdgfaP20033 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PdgfaP20033 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
PdgfaP20033 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PdgfaP20033 Gm45609-204ENSMUST00000209837 1207 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PdgfaP20033 Gm6991-201ENSMUST00000218475 1178 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
PdgfaP20033 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
PdgfaP20033 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PdgfaP20033 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PdgfaP20033 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PdgfaP20033 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
PdgfaP20033 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PdgfaP20033 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PdgfaP20033 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PdgfaP20033 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PdgfaP20033 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PdgfaP20033 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PdgfaP20033 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PdgfaP20033 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PdgfaP20033 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PdgfaP20033 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PdgfaP20033 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PdgfaP20033 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PdgfaP20033 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PdgfaP20033 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
PdgfaP20033 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PdgfaP20033 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PdgfaP20033 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
PdgfaP20033 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PdgfaP20033 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PdgfaP20033 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PdgfaP20033 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PdgfaP20033 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PdgfaP20033 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PdgfaP20033 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PdgfaP20033 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PdgfaP20033 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PdgfaP20033 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PdgfaP20033 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PdgfaP20033 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PdgfaP20033 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
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PdgfaP20033 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PdgfaP20033 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PdgfaP20033 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
PdgfaP20033 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PdgfaP20033 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PdgfaP20033 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PdgfaP20033 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PdgfaP20033 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
PdgfaP20033 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PdgfaP20033 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
PdgfaP20033 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PdgfaP20033 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PdgfaP20033 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PdgfaP20033 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PdgfaP20033 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PdgfaP20033 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PdgfaP20033 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PdgfaP20033 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PdgfaP20033 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PdgfaP20033 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PdgfaP20033 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PdgfaP20033 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PdgfaP20033 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PdgfaP20033 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PdgfaP20033 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PdgfaP20033 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PdgfaP20033 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
PdgfaP20033 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PdgfaP20033 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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