Protein–RNA interactions for Protein: P18828

Sdc1, Syndecan-1, mousemouse

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Length 311 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdc1P18828 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Sdc1P18828 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sdc1P18828 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sdc1P18828 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sdc1P18828 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sdc1P18828 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sdc1P18828 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sdc1P18828 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sdc1P18828 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sdc1P18828 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sdc1P18828 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sdc1P18828 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sdc1P18828 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sdc1P18828 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sdc1P18828 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sdc1P18828 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sdc1P18828 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sdc1P18828 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sdc1P18828 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sdc1P18828 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sdc1P18828 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sdc1P18828 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sdc1P18828 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sdc1P18828 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sdc1P18828 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sdc1P18828 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sdc1P18828 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sdc1P18828 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sdc1P18828 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sdc1P18828 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sdc1P18828 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sdc1P18828 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Sdc1P18828 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sdc1P18828 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sdc1P18828 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sdc1P18828 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sdc1P18828 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sdc1P18828 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sdc1P18828 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sdc1P18828 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sdc1P18828 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sdc1P18828 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sdc1P18828 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sdc1P18828 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sdc1P18828 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sdc1P18828 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sdc1P18828 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sdc1P18828 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sdc1P18828 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sdc1P18828 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sdc1P18828 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sdc1P18828 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sdc1P18828 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Sdc1P18828 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Sdc1P18828 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sdc1P18828 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Sdc1P18828 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Sdc1P18828 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sdc1P18828 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sdc1P18828 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sdc1P18828 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sdc1P18828 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sdc1P18828 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sdc1P18828 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sdc1P18828 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sdc1P18828 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sdc1P18828 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sdc1P18828 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sdc1P18828 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sdc1P18828 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sdc1P18828 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sdc1P18828 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sdc1P18828 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sdc1P18828 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sdc1P18828 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sdc1P18828 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sdc1P18828 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sdc1P18828 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sdc1P18828 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sdc1P18828 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sdc1P18828 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sdc1P18828 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sdc1P18828 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sdc1P18828 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sdc1P18828 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sdc1P18828 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sdc1P18828 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Sdc1P18828 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sdc1P18828 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sdc1P18828 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sdc1P18828 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Sdc1P18828 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sdc1P18828 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sdc1P18828 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sdc1P18828 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sdc1P18828 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Sdc1P18828 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sdc1P18828 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sdc1P18828 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Sdc1P18828 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
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