Protein–RNA interactions for Protein: P18528

Ig heavy chain V region 6.96, mousemouse

Predictions only

Length 98 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18528 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
P18528 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P18528 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
P18528 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
P18528 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P18528 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P18528 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P18528 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P18528 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
P18528 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P18528 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
P18528 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P18528 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
P18528 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P18528 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P18528 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
P18528 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P18528 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
P18528 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P18528 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P18528 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P18528 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P18528 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
P18528 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
P18528 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
P18528 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
P18528 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P18528 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P18528 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
P18528 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
P18528 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P18528 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P18528 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P18528 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P18528 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P18528 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P18528 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P18528 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P18528 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
P18528 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
P18528 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P18528 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P18528 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P18528 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P18528 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
P18528 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P18528 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
P18528 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
P18528 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
P18528 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
P18528 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P18528 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P18528 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P18528 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P18528 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P18528 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P18528 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P18528 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P18528 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P18528 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P18528 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P18528 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
P18528 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
P18528 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P18528 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P18528 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P18528 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P18528 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P18528 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P18528 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P18528 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P18528 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
P18528 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
P18528 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P18528 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P18528 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
P18528 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
P18528 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P18528 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
P18528 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P18528 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P18528 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
P18528 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P18528 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P18528 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
P18528 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P18528 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P18528 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
P18528 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P18528 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
P18528 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
P18528 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
P18528 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
P18528 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
P18528 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
P18528 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
P18528 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
P18528 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
P18528 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
P18528 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.2 ms