Protein–RNA interactions for Protein: P17919

Hoxb1, Homeobox protein Hox-B1, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb1P17919 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxb1P17919 5930430L01Rik-201ENSMUST00000145042 3994 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxb1P17919 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxb1P17919 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxb1P17919 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxb1P17919 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Hoxb1P17919 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Hoxb1P17919 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Hoxb1P17919 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Hoxb1P17919 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.55
Hoxb1P17919 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.55
Hoxb1P17919 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.55
Hoxb1P17919 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hoxb1P17919 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hoxb1P17919 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hoxb1P17919 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Hoxb1P17919 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hoxb1P17919 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hoxb1P17919 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hoxb1P17919 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hoxb1P17919 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hoxb1P17919 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hoxb1P17919 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Hoxb1P17919 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hoxb1P17919 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hoxb1P17919 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hoxb1P17919 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Hoxb1P17919 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hoxb1P17919 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hoxb1P17919 AC123738.2-201ENSMUST00000223791 1899 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Hoxb1P17919 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hoxb1P17919 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Hoxb1P17919 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Hoxb1P17919 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Hoxb1P17919 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Hoxb1P17919 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hoxb1P17919 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Hoxb1P17919 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Hoxb1P17919 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Hoxb1P17919 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Hoxb1P17919 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Hoxb1P17919 Gm28707-201ENSMUST00000186134 558 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hoxb1P17919 Gm29331-201ENSMUST00000187215 605 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hoxb1P17919 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hoxb1P17919 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hoxb1P17919 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hoxb1P17919 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Hoxb1P17919 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hoxb1P17919 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hoxb1P17919 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hoxb1P17919 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hoxb1P17919 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hoxb1P17919 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hoxb1P17919 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hoxb1P17919 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hoxb1P17919 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hoxb1P17919 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hoxb1P17919 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hoxb1P17919 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hoxb1P17919 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Hoxb1P17919 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hoxb1P17919 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hoxb1P17919 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hoxb1P17919 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hoxb1P17919 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hoxb1P17919 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hoxb1P17919 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Hoxb1P17919 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Hoxb1P17919 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Hoxb1P17919 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Hoxb1P17919 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Hoxb1P17919 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Hoxb1P17919 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Hoxb1P17919 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Hoxb1P17919 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Hoxb1P17919 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Hoxb1P17919 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Hoxb1P17919 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Hoxb1P17919 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Hoxb1P17919 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Hoxb1P17919 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Hoxb1P17919 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Hoxb1P17919 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Hoxb1P17919 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Hoxb1P17919 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Hoxb1P17919 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Hoxb1P17919 Gm26952-201ENSMUST00000181996 409 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Hoxb1P17919 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Hoxb1P17919 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Hoxb1P17919 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Hoxb1P17919 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Hoxb1P17919 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Hoxb1P17919 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Hoxb1P17919 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Hoxb1P17919 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Hoxb1P17919 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Hoxb1P17919 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Hoxb1P17919 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Hoxb1P17919 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Hoxb1P17919 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.9 ms