Protein–RNA interactions for Protein: P16546

Sptan1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptan1P16546 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sptan1P16546 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sptan1P16546 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sptan1P16546 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sptan1P16546 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sptan1P16546 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sptan1P16546 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sptan1P16546 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Sptan1P16546 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sptan1P16546 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sptan1P16546 Gm17391-201ENSMUST00000171036 126 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Sptan1P16546 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sptan1P16546 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Sptan1P16546 Plp2-201ENSMUST00000033486 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sptan1P16546 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sptan1P16546 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sptan1P16546 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sptan1P16546 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sptan1P16546 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sptan1P16546 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sptan1P16546 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Sptan1P16546 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sptan1P16546 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sptan1P16546 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sptan1P16546 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sptan1P16546 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sptan1P16546 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sptan1P16546 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sptan1P16546 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sptan1P16546 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sptan1P16546 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sptan1P16546 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sptan1P16546 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sptan1P16546 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Sptan1P16546 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sptan1P16546 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Sptan1P16546 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Sptan1P16546 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sptan1P16546 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sptan1P16546 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sptan1P16546 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Sptan1P16546 Gm29187-201ENSMUST00000186681 689 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sptan1P16546 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sptan1P16546 4930447N08Rik-203ENSMUST00000198879 1157 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sptan1P16546 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Sptan1P16546 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sptan1P16546 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sptan1P16546 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Sptan1P16546 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sptan1P16546 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sptan1P16546 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sptan1P16546 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sptan1P16546 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sptan1P16546 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sptan1P16546 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sptan1P16546 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sptan1P16546 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sptan1P16546 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sptan1P16546 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sptan1P16546 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sptan1P16546 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sptan1P16546 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sptan1P16546 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sptan1P16546 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sptan1P16546 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sptan1P16546 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sptan1P16546 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sptan1P16546 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sptan1P16546 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sptan1P16546 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Sptan1P16546 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sptan1P16546 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sptan1P16546 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sptan1P16546 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sptan1P16546 Olfr76-201ENSMUST00000087822 1048 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sptan1P16546 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sptan1P16546 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sptan1P16546 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sptan1P16546 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sptan1P16546 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sptan1P16546 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sptan1P16546 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sptan1P16546 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sptan1P16546 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Sptan1P16546 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sptan1P16546 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sptan1P16546 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sptan1P16546 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sptan1P16546 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sptan1P16546 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sptan1P16546 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sptan1P16546 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sptan1P16546 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sptan1P16546 Qdpr-209ENSMUST00000198258 1172 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sptan1P16546 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sptan1P16546 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sptan1P16546 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sptan1P16546 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sptan1P16546 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sptan1P16546 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms