Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Vpreb1P13372 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Vpreb1P13372 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Vpreb1P13372 Zfp462-202ENSMUST00000079605 4684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
Vpreb1P13372 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Vpreb1P13372 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Vpreb1P13372 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
Vpreb1P13372 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
Vpreb1P13372 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Vpreb1P13372 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
Vpreb1P13372 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
Vpreb1P13372 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
Vpreb1P13372 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Vpreb1P13372 Scml2-201ENSMUST00000019101 4842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Vpreb1P13372 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Vpreb1P13372 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Vpreb1P13372 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Vpreb1P13372 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Vpreb1P13372 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Vpreb1P13372 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.48□□□□□ -1.05
Vpreb1P13372 Ntrk2-201ENSMUST00000079828 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Vpreb1P13372 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Vpreb1P13372 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Vpreb1P13372 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Vpreb1P13372 Cyp26b1-202ENSMUST00000168003 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Vpreb1P13372 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Vpreb1P13372 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
Vpreb1P13372 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
Vpreb1P13372 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
Vpreb1P13372 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
Vpreb1P13372 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Vpreb1P13372 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Vpreb1P13372 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
Vpreb1P13372 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Vpreb1P13372 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Vpreb1P13372 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
Vpreb1P13372 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Vpreb1P13372 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Vpreb1P13372 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
Vpreb1P13372 Socs6-201ENSMUST00000070116 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Vpreb1P13372 Pcdh10-202ENSMUST00000170695 8234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Vpreb1P13372 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.48□□□□□ -1.05
Vpreb1P13372 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Vpreb1P13372 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Vpreb1P13372 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Vpreb1P13372 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Vpreb1P13372 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Vpreb1P13372 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
Vpreb1P13372 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Vpreb1P13372 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Vpreb1P13372 Adora1-203ENSMUST00000169927 4581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
Vpreb1P13372 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
Vpreb1P13372 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Vpreb1P13372 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.48□□□□□ -1.05
Vpreb1P13372 Surf6-201ENSMUST00000047632 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Vpreb1P13372 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
Vpreb1P13372 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Vpreb1P13372 Abcc10-202ENSMUST00000095261 5266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Vpreb1P13372 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
Vpreb1P13372 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Vpreb1P13372 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC8.47□□□□□ -1.05
Vpreb1P13372 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Vpreb1P13372 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.47□□□□□ -1.05
Vpreb1P13372 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Vpreb1P13372 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Vpreb1P13372 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Vpreb1P13372 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.47□□□□□ -1.05
Vpreb1P13372 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Vpreb1P13372 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Vpreb1P13372 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Vpreb1P13372 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
Vpreb1P13372 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.47□□□□□ -1.05
Vpreb1P13372 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Vpreb1P13372 A130071D04Rik-201ENSMUST00000194467 5864 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
Vpreb1P13372 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Vpreb1P13372 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Vpreb1P13372 Megf8-201ENSMUST00000128119 10040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Vpreb1P13372 AC174678.2-201ENSMUST00000156420 3275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.47□□□□□ -1.05
Vpreb1P13372 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
Vpreb1P13372 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Vpreb1P13372 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.47□□□□□ -1.05
Vpreb1P13372 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
Vpreb1P13372 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Vpreb1P13372 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
Vpreb1P13372 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Vpreb1P13372 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Vpreb1P13372 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Vpreb1P13372 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
Vpreb1P13372 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC8.47□□□□□ -1.05
Vpreb1P13372 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
Vpreb1P13372 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Vpreb1P13372 Bcl2l2-203ENSMUST00000133397 3813 ntTSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Vpreb1P13372 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Vpreb1P13372 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Vpreb1P13372 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.47□□□□□ -1.05
Vpreb1P13372 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.47□□□□□ -1.05
Vpreb1P13372 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
Vpreb1P13372 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Vpreb1P13372 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC8.47□□□□□ -1.05
Vpreb1P13372 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms