Protein–RNA interactions for Protein: P11531

Dmd, Dystrophin, mousemouse

Predictions only

Length 3,678 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DmdP11531 Gm37299-201ENSMUST00000193951 826 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
DmdP11531 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
DmdP11531 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
DmdP11531 1110019B22Rik-202ENSMUST00000218396 989 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
DmdP11531 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
DmdP11531 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
DmdP11531 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
DmdP11531 Clec4b1-202ENSMUST00000078559 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
DmdP11531 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
DmdP11531 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
DmdP11531 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
DmdP11531 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
DmdP11531 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
DmdP11531 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
DmdP11531 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
DmdP11531 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
DmdP11531 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
DmdP11531 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
DmdP11531 Cd1d2-202ENSMUST00000192481 1131 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
DmdP11531 Pbld1-206ENSMUST00000219687 788 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
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DmdP11531 Gm14005-208ENSMUST00000223654 681 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
DmdP11531 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
DmdP11531 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
DmdP11531 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
DmdP11531 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
DmdP11531 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
DmdP11531 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
DmdP11531 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
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DmdP11531 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
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DmdP11531 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
DmdP11531 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
DmdP11531 AA545190-201ENSMUST00000203495 1053 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
DmdP11531 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
DmdP11531 Gm9139-201ENSMUST00000218817 700 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
DmdP11531 AC126799.1-201ENSMUST00000221976 246 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
DmdP11531 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
DmdP11531 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
DmdP11531 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
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DmdP11531 Rdh9-203ENSMUST00000136223 1276 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
DmdP11531 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
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DmdP11531 Hcrtr1-204ENSMUST00000164887 1251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
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DmdP11531 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
DmdP11531 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
DmdP11531 5530401A14Rik-201ENSMUST00000021044 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
DmdP11531 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
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DmdP11531 BC016548-202ENSMUST00000153797 805 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
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DmdP11531 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
DmdP11531 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
DmdP11531 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
DmdP11531 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
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DmdP11531 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
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DmdP11531 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
DmdP11531 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
DmdP11531 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
DmdP11531 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
DmdP11531 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
DmdP11531 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
DmdP11531 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
DmdP11531 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
DmdP11531 E030018B13Rik-201ENSMUST00000177638 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
DmdP11531 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
DmdP11531 Arhgef33-210ENSMUST00000225548 456 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
DmdP11531 Gm9774-201ENSMUST00000047300 1064 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
DmdP11531 Spink2-201ENSMUST00000065216 631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
DmdP11531 1700029P11Rik-201ENSMUST00000074608 1024 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
DmdP11531 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
DmdP11531 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
DmdP11531 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
DmdP11531 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
DmdP11531 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
DmdP11531 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
DmdP11531 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
DmdP11531 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
DmdP11531 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
DmdP11531 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
DmdP11531 Gm13668-201ENSMUST00000119237 1001 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
DmdP11531 1810021B22Rik-201ENSMUST00000150364 652 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
DmdP11531 Gm29292-201ENSMUST00000186169 766 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
DmdP11531 Gm45338-201ENSMUST00000209198 820 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms