Protein–RNA interactions for Protein: P10404

MLV-related proviral Env polyprotein, mousemouse

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Length 641 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P10404 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
P10404 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
P10404 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
P10404 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
P10404 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
P10404 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
P10404 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
P10404 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
P10404 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
P10404 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
P10404 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
P10404 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
P10404 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
P10404 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
P10404 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
P10404 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
P10404 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
P10404 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
P10404 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
P10404 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
P10404 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
P10404 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
P10404 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
P10404 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
P10404 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
P10404 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
P10404 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
P10404 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
P10404 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
P10404 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
P10404 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
P10404 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
P10404 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
P10404 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
P10404 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
P10404 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
P10404 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
P10404 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
P10404 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
P10404 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
P10404 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
P10404 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
P10404 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
P10404 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
P10404 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
P10404 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
P10404 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
P10404 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
P10404 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
P10404 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
P10404 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
P10404 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
P10404 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
P10404 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
P10404 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
P10404 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
P10404 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
P10404 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
P10404 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
P10404 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
P10404 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
P10404 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
P10404 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
P10404 4930433J02Rik-201ENSMUST00000194719 1386 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
P10404 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
P10404 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
P10404 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
P10404 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
P10404 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
P10404 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
P10404 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
P10404 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
P10404 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
P10404 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
P10404 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
P10404 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
P10404 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
P10404 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
P10404 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
P10404 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
P10404 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
P10404 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
P10404 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
P10404 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
P10404 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
P10404 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
P10404 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
P10404 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
P10404 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
P10404 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
P10404 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
P10404 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
P10404 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
P10404 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
P10404 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
P10404 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
P10404 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
P10404 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
P10404 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
P10404 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms