Protein–RNA interactions for Protein: P10284

Hoxb4, Homeobox protein Hox-B4, mousemouse

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb4P10284 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxb4P10284 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxb4P10284 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxb4P10284 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxb4P10284 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxb4P10284 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxb4P10284 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxb4P10284 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxb4P10284 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxb4P10284 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxb4P10284 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxb4P10284 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxb4P10284 Tulp2-202ENSMUST00000085331 1525 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxb4P10284 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxb4P10284 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxb4P10284 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxb4P10284 Gm7680-201ENSMUST00000216198 1348 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxb4P10284 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxb4P10284 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxb4P10284 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxb4P10284 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxb4P10284 Adcyap1r1-204ENSMUST00000165857 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxb4P10284 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxb4P10284 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxb4P10284 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxb4P10284 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxb4P10284 Pcnp-203ENSMUST00000119981 901 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxb4P10284 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxb4P10284 2310057J18Rik-204ENSMUST00000152363 1043 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxb4P10284 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxb4P10284 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxb4P10284 4930599N24Rik-201ENSMUST00000198822 1003 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxb4P10284 Fgf5-202ENSMUST00000200059 600 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxb4P10284 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxb4P10284 Gm29676-202ENSMUST00000222409 364 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxb4P10284 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxb4P10284 Nceh1-202ENSMUST00000091284 830 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxb4P10284 Vpreb3-201ENSMUST00000000926 625 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxb4P10284 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxb4P10284 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxb4P10284 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxb4P10284 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxb4P10284 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxb4P10284 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxb4P10284 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxb4P10284 Gm10785-201ENSMUST00000156242 1583 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxb4P10284 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxb4P10284 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxb4P10284 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxb4P10284 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxb4P10284 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxb4P10284 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxb4P10284 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxb4P10284 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxb4P10284 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxb4P10284 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxb4P10284 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxb4P10284 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxb4P10284 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxb4P10284 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxb4P10284 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxb4P10284 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxb4P10284 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxb4P10284 Gm43216-201ENSMUST00000196295 1333 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxb4P10284 Gm44746-201ENSMUST00000205565 1349 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxb4P10284 Olfr1288-202ENSMUST00000214816 1326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxb4P10284 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxb4P10284 Gm28360-201ENSMUST00000187455 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxb4P10284 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxb4P10284 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxb4P10284 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxb4P10284 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxb4P10284 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxb4P10284 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxb4P10284 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxb4P10284 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxb4P10284 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxb4P10284 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxb4P10284 Rps28-203ENSMUST00000173019 437 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxb4P10284 Smr2-202ENSMUST00000196070 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxb4P10284 Gm42452-201ENSMUST00000199749 617 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxb4P10284 Diablo-210ENSMUST00000200247 748 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxb4P10284 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxb4P10284 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxb4P10284 Gm44681-201ENSMUST00000208447 842 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxb4P10284 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxb4P10284 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxb4P10284 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxb4P10284 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxb4P10284 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxb4P10284 Gm20063-201ENSMUST00000220757 1089 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxb4P10284 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxb4P10284 Desi2-202ENSMUST00000069568 1193 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxb4P10284 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxb4P10284 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxb4P10284 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxb4P10284 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxb4P10284 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxb4P10284 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxb4P10284 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
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