Protein–RNA interactions for Protein: P10148

Ccl2, C-C motif chemokine 2, mousemouse

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Length 148 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl2P10148 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccl2P10148 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccl2P10148 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccl2P10148 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccl2P10148 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccl2P10148 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccl2P10148 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccl2P10148 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccl2P10148 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccl2P10148 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccl2P10148 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccl2P10148 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccl2P10148 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccl2P10148 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccl2P10148 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccl2P10148 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccl2P10148 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccl2P10148 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccl2P10148 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccl2P10148 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccl2P10148 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccl2P10148 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccl2P10148 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccl2P10148 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccl2P10148 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccl2P10148 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccl2P10148 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccl2P10148 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccl2P10148 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccl2P10148 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccl2P10148 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccl2P10148 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccl2P10148 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccl2P10148 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccl2P10148 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccl2P10148 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccl2P10148 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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Ccl2P10148 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccl2P10148 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccl2P10148 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccl2P10148 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccl2P10148 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
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Ccl2P10148 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccl2P10148 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
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Ccl2P10148 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccl2P10148 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccl2P10148 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccl2P10148 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
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Ccl2P10148 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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Ccl2P10148 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccl2P10148 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccl2P10148 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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Ccl2P10148 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccl2P10148 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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Ccl2P10148 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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Ccl2P10148 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccl2P10148 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccl2P10148 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccl2P10148 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccl2P10148 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccl2P10148 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccl2P10148 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccl2P10148 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccl2P10148 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccl2P10148 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccl2P10148 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccl2P10148 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccl2P10148 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
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Ccl2P10148 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccl2P10148 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccl2P10148 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccl2P10148 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccl2P10148 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccl2P10148 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccl2P10148 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccl2P10148 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccl2P10148 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccl2P10148 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccl2P10148 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccl2P10148 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccl2P10148 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccl2P10148 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccl2P10148 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccl2P10148 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
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