Protein–RNA interactions for Protein: P10085

Myod1, Myoblast determination protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 318 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myod1P10085 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Myod1P10085 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Myod1P10085 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Myod1P10085 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Myod1P10085 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Myod1P10085 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Myod1P10085 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Myod1P10085 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Myod1P10085 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Myod1P10085 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Myod1P10085 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Myod1P10085 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Myod1P10085 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Myod1P10085 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Myod1P10085 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Myod1P10085 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Myod1P10085 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Myod1P10085 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Myod1P10085 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Myod1P10085 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Myod1P10085 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Myod1P10085 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Myod1P10085 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Myod1P10085 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Myod1P10085 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Myod1P10085 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Myod1P10085 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Myod1P10085 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Myod1P10085 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Myod1P10085 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Myod1P10085 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Myod1P10085 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Myod1P10085 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Myod1P10085 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Myod1P10085 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Myod1P10085 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Myod1P10085 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Myod1P10085 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Myod1P10085 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Myod1P10085 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Myod1P10085 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Myod1P10085 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Myod1P10085 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Myod1P10085 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Myod1P10085 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Myod1P10085 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Myod1P10085 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Myod1P10085 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Myod1P10085 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Myod1P10085 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Myod1P10085 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Myod1P10085 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Myod1P10085 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Myod1P10085 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Myod1P10085 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Myod1P10085 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Myod1P10085 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Myod1P10085 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Myod1P10085 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Myod1P10085 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Myod1P10085 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Myod1P10085 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Myod1P10085 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Myod1P10085 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Myod1P10085 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Myod1P10085 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Myod1P10085 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Myod1P10085 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Myod1P10085 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Myod1P10085 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Myod1P10085 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Myod1P10085 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Myod1P10085 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Myod1P10085 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Myod1P10085 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Myod1P10085 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Myod1P10085 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Myod1P10085 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Myod1P10085 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Myod1P10085 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Myod1P10085 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Myod1P10085 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Myod1P10085 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Myod1P10085 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Myod1P10085 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Myod1P10085 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Myod1P10085 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Myod1P10085 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Myod1P10085 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Myod1P10085 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Myod1P10085 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Myod1P10085 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Myod1P10085 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Myod1P10085 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Myod1P10085 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Myod1P10085 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Myod1P10085 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Myod1P10085 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Myod1P10085 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Myod1P10085 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.7 ms