Protein–RNA interactions for Protein: P09225

Lta, Lymphotoxin-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtaP09225 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
LtaP09225 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
LtaP09225 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
LtaP09225 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
LtaP09225 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
LtaP09225 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
LtaP09225 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
LtaP09225 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
LtaP09225 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
LtaP09225 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
LtaP09225 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
LtaP09225 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
LtaP09225 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
LtaP09225 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
LtaP09225 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
LtaP09225 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
LtaP09225 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
LtaP09225 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
LtaP09225 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
LtaP09225 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
LtaP09225 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
LtaP09225 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
LtaP09225 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
LtaP09225 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
LtaP09225 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
LtaP09225 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
LtaP09225 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
LtaP09225 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
LtaP09225 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
LtaP09225 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
LtaP09225 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
LtaP09225 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
LtaP09225 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
LtaP09225 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
LtaP09225 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
LtaP09225 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
LtaP09225 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
LtaP09225 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
LtaP09225 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
LtaP09225 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
LtaP09225 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
LtaP09225 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
LtaP09225 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
LtaP09225 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
LtaP09225 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
LtaP09225 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
LtaP09225 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
LtaP09225 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
LtaP09225 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
LtaP09225 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
LtaP09225 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
LtaP09225 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
LtaP09225 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
LtaP09225 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
LtaP09225 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
LtaP09225 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
LtaP09225 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
LtaP09225 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
LtaP09225 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
LtaP09225 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
LtaP09225 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
LtaP09225 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
LtaP09225 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
LtaP09225 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
LtaP09225 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
LtaP09225 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
LtaP09225 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
LtaP09225 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
LtaP09225 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
LtaP09225 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
LtaP09225 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
LtaP09225 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
LtaP09225 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
LtaP09225 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
LtaP09225 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
LtaP09225 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
LtaP09225 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
LtaP09225 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
LtaP09225 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
LtaP09225 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
LtaP09225 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
LtaP09225 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
LtaP09225 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
LtaP09225 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
LtaP09225 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
LtaP09225 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
LtaP09225 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
LtaP09225 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
LtaP09225 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
LtaP09225 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
LtaP09225 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
LtaP09225 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
LtaP09225 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
LtaP09225 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
LtaP09225 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
LtaP09225 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
LtaP09225 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
LtaP09225 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
LtaP09225 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
LtaP09225 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms