Protein–RNA interactions for Protein: P08121

Col3a1, Collagen alpha-1(III) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col3a1P08121 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col3a1P08121 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col3a1P08121 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col3a1P08121 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col3a1P08121 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col3a1P08121 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col3a1P08121 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col3a1P08121 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col3a1P08121 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Col3a1P08121 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col3a1P08121 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col3a1P08121 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col3a1P08121 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col3a1P08121 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col3a1P08121 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Col3a1P08121 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col3a1P08121 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col3a1P08121 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col3a1P08121 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col3a1P08121 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col3a1P08121 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Col3a1P08121 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Col3a1P08121 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col3a1P08121 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Col3a1P08121 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col3a1P08121 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col3a1P08121 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col3a1P08121 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col3a1P08121 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Col3a1P08121 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col3a1P08121 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col3a1P08121 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col3a1P08121 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col3a1P08121 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col3a1P08121 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col3a1P08121 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col3a1P08121 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col3a1P08121 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col3a1P08121 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col3a1P08121 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col3a1P08121 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col3a1P08121 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col3a1P08121 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Col3a1P08121 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col3a1P08121 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col3a1P08121 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col3a1P08121 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col3a1P08121 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col3a1P08121 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col3a1P08121 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col3a1P08121 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col3a1P08121 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Col3a1P08121 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Col3a1P08121 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col3a1P08121 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col3a1P08121 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col3a1P08121 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col3a1P08121 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col3a1P08121 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col3a1P08121 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col3a1P08121 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col3a1P08121 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Col3a1P08121 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col3a1P08121 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col3a1P08121 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col3a1P08121 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col3a1P08121 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col3a1P08121 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col3a1P08121 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col3a1P08121 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col3a1P08121 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col3a1P08121 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col3a1P08121 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col3a1P08121 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col3a1P08121 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col3a1P08121 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col3a1P08121 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col3a1P08121 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col3a1P08121 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col3a1P08121 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col3a1P08121 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col3a1P08121 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col3a1P08121 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col3a1P08121 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col3a1P08121 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col3a1P08121 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col3a1P08121 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Col3a1P08121 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col3a1P08121 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col3a1P08121 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col3a1P08121 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col3a1P08121 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col3a1P08121 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col3a1P08121 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Col3a1P08121 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Col3a1P08121 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col3a1P08121 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Col3a1P08121 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Col3a1P08121 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col3a1P08121 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.8 ms