Protein–RNA interactions for Protein: P08032

Spta1, Spectrin alpha chain, erythrocytic 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spta1P08032 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Spta1P08032 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Spta1P08032 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Spta1P08032 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Spta1P08032 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Spta1P08032 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Spta1P08032 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Spta1P08032 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Spta1P08032 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Spta1P08032 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Spta1P08032 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Spta1P08032 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Spta1P08032 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Spta1P08032 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Spta1P08032 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Spta1P08032 Gm16397-201ENSMUST00000122201 494 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Spta1P08032 Gm14199-201ENSMUST00000130021 495 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Spta1P08032 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Spta1P08032 Gm20392-201ENSMUST00000173047 701 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Spta1P08032 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Spta1P08032 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Spta1P08032 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Spta1P08032 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Spta1P08032 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Spta1P08032 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Spta1P08032 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Spta1P08032 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Spta1P08032 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Spta1P08032 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Spta1P08032 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Spta1P08032 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Spta1P08032 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Spta1P08032 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Spta1P08032 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Spta1P08032 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Spta1P08032 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Spta1P08032 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Spta1P08032 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Spta1P08032 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Spta1P08032 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Spta1P08032 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Spta1P08032 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Spta1P08032 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Spta1P08032 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Spta1P08032 Gm11667-201ENSMUST00000119828 486 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Spta1P08032 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Spta1P08032 Nudt2-201ENSMUST00000030154 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Spta1P08032 Defb36-201ENSMUST00000058086 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Spta1P08032 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Spta1P08032 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Spta1P08032 Sparc-209ENSMUST00000216313 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Spta1P08032 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Spta1P08032 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Spta1P08032 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Spta1P08032 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Spta1P08032 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Spta1P08032 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Spta1P08032 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Spta1P08032 Gm15131-201ENSMUST00000119124 595 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Spta1P08032 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Spta1P08032 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Spta1P08032 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Spta1P08032 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Spta1P08032 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Spta1P08032 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Spta1P08032 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Spta1P08032 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Spta1P08032 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Spta1P08032 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Spta1P08032 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Spta1P08032 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Spta1P08032 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Spta1P08032 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Spta1P08032 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Spta1P08032 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Spta1P08032 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Spta1P08032 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Spta1P08032 E230034D01Rik-201ENSMUST00000214440 1212 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Spta1P08032 Prm3-201ENSMUST00000050864 410 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Spta1P08032 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Spta1P08032 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Spta1P08032 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Spta1P08032 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Spta1P08032 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Spta1P08032 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Spta1P08032 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Spta1P08032 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Spta1P08032 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Spta1P08032 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Spta1P08032 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Spta1P08032 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Spta1P08032 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Spta1P08032 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Spta1P08032 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Spta1P08032 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Spta1P08032 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Spta1P08032 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Spta1P08032 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Spta1P08032 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Spta1P08032 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms