Protein–RNA interactions for Protein: P07607

Tyms, Thymidylate synthase, mousemouse

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Length 307 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TymsP07607 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
TymsP07607 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
TymsP07607 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
TymsP07607 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
TymsP07607 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
TymsP07607 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
TymsP07607 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
TymsP07607 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
TymsP07607 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
TymsP07607 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
TymsP07607 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
TymsP07607 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
TymsP07607 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
TymsP07607 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
TymsP07607 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
TymsP07607 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
TymsP07607 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
TymsP07607 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
TymsP07607 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
TymsP07607 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
TymsP07607 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
TymsP07607 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
TymsP07607 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
TymsP07607 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
TymsP07607 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
TymsP07607 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
TymsP07607 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
TymsP07607 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
TymsP07607 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
TymsP07607 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
TymsP07607 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
TymsP07607 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
TymsP07607 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
TymsP07607 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
TymsP07607 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
TymsP07607 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
TymsP07607 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
TymsP07607 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
TymsP07607 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
TymsP07607 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
TymsP07607 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
TymsP07607 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
TymsP07607 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
TymsP07607 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
TymsP07607 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
TymsP07607 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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TymsP07607 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
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TymsP07607 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
TymsP07607 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
TymsP07607 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
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TymsP07607 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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TymsP07607 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
TymsP07607 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
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TymsP07607 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
TymsP07607 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
TymsP07607 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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TymsP07607 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
TymsP07607 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
TymsP07607 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
TymsP07607 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
TymsP07607 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
TymsP07607 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
TymsP07607 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
TymsP07607 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
TymsP07607 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
TymsP07607 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
TymsP07607 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
TymsP07607 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
TymsP07607 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
TymsP07607 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.76
TymsP07607 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
TymsP07607 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
TymsP07607 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
TymsP07607 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
TymsP07607 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
TymsP07607 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
TymsP07607 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
TymsP07607 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
TymsP07607 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
TymsP07607 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms