Protein–RNA interactions for Protein: P06330

Ig heavy chain V region AC38 205.12, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P06330 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
P06330 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
P06330 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
P06330 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
P06330 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
P06330 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
P06330 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
P06330 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
P06330 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
P06330 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
P06330 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
P06330 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
P06330 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
P06330 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
P06330 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
P06330 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
P06330 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
P06330 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
P06330 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
P06330 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
P06330 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
P06330 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
P06330 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC10□□□□□ -0.81
P06330 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
P06330 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
P06330 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P06330 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P06330 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
P06330 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC10□□□□□ -0.81
P06330 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P06330 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P06330 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P06330 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P06330 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P06330 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC10□□□□□ -0.81
P06330 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P06330 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
P06330 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P06330 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P06330 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
P06330 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
P06330 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
P06330 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
P06330 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
P06330 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
P06330 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
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P06330 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P06330 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P06330 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
P06330 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
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P06330 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P06330 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P06330 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P06330 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
P06330 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC10□□□□□ -0.81
P06330 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P06330 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P06330 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
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P06330 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
P06330 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P06330 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P06330 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P06330 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P06330 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
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P06330 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
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P06330 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
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P06330 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P06330 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P06330 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P06330 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
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P06330 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P06330 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P06330 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P06330 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
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P06330 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P06330 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P06330 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P06330 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
P06330 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
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P06330 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P06330 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P06330 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
P06330 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
P06330 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
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