Protein–RNA interactions for Protein: P05622

Pdgfrb, Platelet-derived growth factor receptor beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,098 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfrbP05622 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PdgfrbP05622 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PdgfrbP05622 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PdgfrbP05622 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PdgfrbP05622 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PdgfrbP05622 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PdgfrbP05622 Gm31409-201ENSMUST00000209894 710 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PdgfrbP05622 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PdgfrbP05622 AC125117.2-201ENSMUST00000228344 1140 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
PdgfrbP05622 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PdgfrbP05622 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PdgfrbP05622 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PdgfrbP05622 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PdgfrbP05622 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PdgfrbP05622 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PdgfrbP05622 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PdgfrbP05622 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PdgfrbP05622 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PdgfrbP05622 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PdgfrbP05622 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PdgfrbP05622 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PdgfrbP05622 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PdgfrbP05622 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PdgfrbP05622 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PdgfrbP05622 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PdgfrbP05622 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PdgfrbP05622 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PdgfrbP05622 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PdgfrbP05622 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PdgfrbP05622 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PdgfrbP05622 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PdgfrbP05622 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PdgfrbP05622 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PdgfrbP05622 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
PdgfrbP05622 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PdgfrbP05622 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PdgfrbP05622 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PdgfrbP05622 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PdgfrbP05622 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PdgfrbP05622 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PdgfrbP05622 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PdgfrbP05622 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PdgfrbP05622 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PdgfrbP05622 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PdgfrbP05622 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PdgfrbP05622 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PdgfrbP05622 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PdgfrbP05622 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PdgfrbP05622 Gm16973-201ENSMUST00000180682 1299 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PdgfrbP05622 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PdgfrbP05622 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PdgfrbP05622 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PdgfrbP05622 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PdgfrbP05622 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PdgfrbP05622 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PdgfrbP05622 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PdgfrbP05622 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PdgfrbP05622 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PdgfrbP05622 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PdgfrbP05622 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PdgfrbP05622 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PdgfrbP05622 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PdgfrbP05622 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PdgfrbP05622 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PdgfrbP05622 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PdgfrbP05622 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PdgfrbP05622 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PdgfrbP05622 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PdgfrbP05622 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PdgfrbP05622 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PdgfrbP05622 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PdgfrbP05622 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PdgfrbP05622 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PdgfrbP05622 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PdgfrbP05622 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PdgfrbP05622 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PdgfrbP05622 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PdgfrbP05622 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PdgfrbP05622 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
PdgfrbP05622 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
PdgfrbP05622 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PdgfrbP05622 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PdgfrbP05622 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PdgfrbP05622 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
PdgfrbP05622 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
PdgfrbP05622 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PdgfrbP05622 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PdgfrbP05622 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PdgfrbP05622 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PdgfrbP05622 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PdgfrbP05622 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PdgfrbP05622 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PdgfrbP05622 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PdgfrbP05622 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PdgfrbP05622 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PdgfrbP05622 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PdgfrbP05622 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PdgfrbP05622 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
PdgfrbP05622 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PdgfrbP05622 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
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