Protein–RNA interactions for Protein: P04230

H2-Eb1, H-2 class II histocompatibility antigen, E-B beta chain, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb1P04230 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
H2-Eb1P04230 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
H2-Eb1P04230 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
H2-Eb1P04230 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
H2-Eb1P04230 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
H2-Eb1P04230 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC13□□□□□ -0.33
H2-Eb1P04230 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
H2-Eb1P04230 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
H2-Eb1P04230 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
H2-Eb1P04230 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
H2-Eb1P04230 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
H2-Eb1P04230 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC13□□□□□ -0.33
H2-Eb1P04230 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC13□□□□□ -0.33
H2-Eb1P04230 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
H2-Eb1P04230 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
H2-Eb1P04230 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
H2-Eb1P04230 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
H2-Eb1P04230 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
H2-Eb1P04230 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
H2-Eb1P04230 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
H2-Eb1P04230 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
H2-Eb1P04230 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
H2-Eb1P04230 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
H2-Eb1P04230 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
H2-Eb1P04230 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
H2-Eb1P04230 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
H2-Eb1P04230 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
H2-Eb1P04230 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
H2-Eb1P04230 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
H2-Eb1P04230 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
H2-Eb1P04230 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
H2-Eb1P04230 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
H2-Eb1P04230 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
H2-Eb1P04230 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
H2-Eb1P04230 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
H2-Eb1P04230 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
H2-Eb1P04230 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
H2-Eb1P04230 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
H2-Eb1P04230 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
H2-Eb1P04230 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
H2-Eb1P04230 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
H2-Eb1P04230 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
H2-Eb1P04230 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
H2-Eb1P04230 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
H2-Eb1P04230 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
H2-Eb1P04230 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
H2-Eb1P04230 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
H2-Eb1P04230 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
H2-Eb1P04230 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
H2-Eb1P04230 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
H2-Eb1P04230 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
H2-Eb1P04230 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
H2-Eb1P04230 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
H2-Eb1P04230 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
H2-Eb1P04230 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
H2-Eb1P04230 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
H2-Eb1P04230 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
H2-Eb1P04230 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
H2-Eb1P04230 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
H2-Eb1P04230 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
H2-Eb1P04230 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
H2-Eb1P04230 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
H2-Eb1P04230 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
H2-Eb1P04230 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
H2-Eb1P04230 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
H2-Eb1P04230 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
H2-Eb1P04230 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
H2-Eb1P04230 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
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H2-Eb1P04230 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
H2-Eb1P04230 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
H2-Eb1P04230 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
H2-Eb1P04230 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
H2-Eb1P04230 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
H2-Eb1P04230 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
H2-Eb1P04230 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
H2-Eb1P04230 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
H2-Eb1P04230 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
H2-Eb1P04230 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
H2-Eb1P04230 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
H2-Eb1P04230 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
H2-Eb1P04230 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
H2-Eb1P04230 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
H2-Eb1P04230 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
H2-Eb1P04230 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
H2-Eb1P04230 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
H2-Eb1P04230 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
H2-Eb1P04230 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
H2-Eb1P04230 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
H2-Eb1P04230 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
H2-Eb1P04230 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
H2-Eb1P04230 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
H2-Eb1P04230 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
H2-Eb1P04230 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
H2-Eb1P04230 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
H2-Eb1P04230 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
H2-Eb1P04230 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
H2-Eb1P04230 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
H2-Eb1P04230 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
H2-Eb1P04230 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
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