Protein–RNA interactions for Protein: O89079

Cope, Coatomer subunit epsilon, mousemouse

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Length 308 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CopeO89079 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
CopeO89079 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
CopeO89079 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
CopeO89079 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
CopeO89079 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
CopeO89079 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
CopeO89079 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
CopeO89079 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CopeO89079 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CopeO89079 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CopeO89079 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CopeO89079 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CopeO89079 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CopeO89079 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CopeO89079 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CopeO89079 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CopeO89079 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CopeO89079 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CopeO89079 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CopeO89079 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CopeO89079 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CopeO89079 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CopeO89079 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CopeO89079 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CopeO89079 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CopeO89079 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CopeO89079 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CopeO89079 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CopeO89079 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CopeO89079 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CopeO89079 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CopeO89079 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CopeO89079 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CopeO89079 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CopeO89079 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CopeO89079 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CopeO89079 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CopeO89079 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
CopeO89079 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CopeO89079 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CopeO89079 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CopeO89079 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CopeO89079 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CopeO89079 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
CopeO89079 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
CopeO89079 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CopeO89079 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CopeO89079 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CopeO89079 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CopeO89079 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CopeO89079 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CopeO89079 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CopeO89079 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CopeO89079 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CopeO89079 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CopeO89079 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CopeO89079 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CopeO89079 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CopeO89079 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
CopeO89079 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CopeO89079 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CopeO89079 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CopeO89079 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CopeO89079 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CopeO89079 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CopeO89079 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CopeO89079 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CopeO89079 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CopeO89079 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CopeO89079 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CopeO89079 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CopeO89079 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CopeO89079 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CopeO89079 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
CopeO89079 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CopeO89079 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CopeO89079 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CopeO89079 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CopeO89079 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CopeO89079 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CopeO89079 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CopeO89079 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CopeO89079 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CopeO89079 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CopeO89079 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
CopeO89079 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CopeO89079 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CopeO89079 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CopeO89079 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CopeO89079 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CopeO89079 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CopeO89079 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CopeO89079 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CopeO89079 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CopeO89079 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CopeO89079 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CopeO89079 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CopeO89079 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CopeO89079 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CopeO89079 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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