Protein–RNA interactions for Protein: O88874

Ccnk, Cyclin-K, mousemouse

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Length 554 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcnkO88874 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
CcnkO88874 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
CcnkO88874 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
CcnkO88874 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
CcnkO88874 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
CcnkO88874 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
CcnkO88874 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
CcnkO88874 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
CcnkO88874 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
CcnkO88874 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
CcnkO88874 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
CcnkO88874 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CcnkO88874 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
CcnkO88874 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CcnkO88874 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CcnkO88874 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CcnkO88874 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CcnkO88874 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CcnkO88874 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CcnkO88874 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CcnkO88874 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CcnkO88874 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CcnkO88874 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CcnkO88874 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CcnkO88874 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
CcnkO88874 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
CcnkO88874 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CcnkO88874 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
CcnkO88874 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CcnkO88874 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CcnkO88874 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CcnkO88874 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CcnkO88874 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
CcnkO88874 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
CcnkO88874 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CcnkO88874 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CcnkO88874 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CcnkO88874 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CcnkO88874 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CcnkO88874 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CcnkO88874 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CcnkO88874 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
CcnkO88874 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CcnkO88874 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CcnkO88874 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CcnkO88874 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
CcnkO88874 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
CcnkO88874 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
CcnkO88874 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CcnkO88874 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
CcnkO88874 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CcnkO88874 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
CcnkO88874 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CcnkO88874 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
CcnkO88874 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CcnkO88874 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CcnkO88874 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CcnkO88874 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
CcnkO88874 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
CcnkO88874 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CcnkO88874 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CcnkO88874 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CcnkO88874 Gm38273-201ENSMUST00000194987 2382 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
CcnkO88874 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CcnkO88874 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
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CcnkO88874 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CcnkO88874 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
CcnkO88874 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
CcnkO88874 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
CcnkO88874 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CcnkO88874 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CcnkO88874 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CcnkO88874 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CcnkO88874 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CcnkO88874 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CcnkO88874 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CcnkO88874 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CcnkO88874 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
CcnkO88874 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CcnkO88874 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CcnkO88874 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CcnkO88874 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
CcnkO88874 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CcnkO88874 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
CcnkO88874 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CcnkO88874 Gm45650-201ENSMUST00000211162 2169 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
CcnkO88874 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CcnkO88874 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CcnkO88874 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CcnkO88874 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CcnkO88874 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CcnkO88874 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CcnkO88874 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CcnkO88874 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CcnkO88874 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
CcnkO88874 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
CcnkO88874 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CcnkO88874 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CcnkO88874 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
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