Protein–RNA interactions for Protein: O70263

Lnx1, E3 ubiquitin-protein ligase LNX, mousemouse

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Length 728 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lnx1O70263 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lnx1O70263 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lnx1O70263 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lnx1O70263 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lnx1O70263 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lnx1O70263 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Lnx1O70263 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lnx1O70263 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lnx1O70263 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lnx1O70263 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lnx1O70263 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lnx1O70263 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lnx1O70263 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lnx1O70263 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lnx1O70263 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lnx1O70263 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lnx1O70263 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lnx1O70263 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lnx1O70263 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lnx1O70263 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lnx1O70263 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lnx1O70263 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Lnx1O70263 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lnx1O70263 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lnx1O70263 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Lnx1O70263 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lnx1O70263 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Lnx1O70263 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lnx1O70263 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lnx1O70263 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lnx1O70263 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lnx1O70263 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lnx1O70263 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lnx1O70263 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lnx1O70263 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lnx1O70263 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lnx1O70263 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lnx1O70263 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Lnx1O70263 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Lnx1O70263 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Lnx1O70263 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Lnx1O70263 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Lnx1O70263 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Lnx1O70263 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Lnx1O70263 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lnx1O70263 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lnx1O70263 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lnx1O70263 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lnx1O70263 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lnx1O70263 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Lnx1O70263 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lnx1O70263 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lnx1O70263 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lnx1O70263 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lnx1O70263 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lnx1O70263 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lnx1O70263 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lnx1O70263 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lnx1O70263 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lnx1O70263 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lnx1O70263 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Lnx1O70263 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Lnx1O70263 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Lnx1O70263 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lnx1O70263 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lnx1O70263 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lnx1O70263 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lnx1O70263 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lnx1O70263 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lnx1O70263 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lnx1O70263 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lnx1O70263 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lnx1O70263 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lnx1O70263 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lnx1O70263 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lnx1O70263 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lnx1O70263 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lnx1O70263 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lnx1O70263 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lnx1O70263 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lnx1O70263 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lnx1O70263 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lnx1O70263 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Lnx1O70263 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lnx1O70263 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lnx1O70263 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lnx1O70263 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lnx1O70263 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lnx1O70263 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lnx1O70263 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lnx1O70263 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Lnx1O70263 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Lnx1O70263 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lnx1O70263 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Lnx1O70263 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lnx1O70263 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lnx1O70263 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Lnx1O70263 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Lnx1O70263 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lnx1O70263 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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