Protein–RNA interactions for Protein: O55203

Ldb2, LIM domain-binding protein 2, mousemouse

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Length 373 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb2O55203 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ldb2O55203 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ldb2O55203 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ldb2O55203 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Ldb2O55203 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Ldb2O55203 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Ldb2O55203 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ldb2O55203 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Ldb2O55203 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ldb2O55203 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ldb2O55203 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ldb2O55203 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ldb2O55203 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ldb2O55203 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Ldb2O55203 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ldb2O55203 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ldb2O55203 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ldb2O55203 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ldb2O55203 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ldb2O55203 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ldb2O55203 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ldb2O55203 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ldb2O55203 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ldb2O55203 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ldb2O55203 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ldb2O55203 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ldb2O55203 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ldb2O55203 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ldb2O55203 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ldb2O55203 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ldb2O55203 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ldb2O55203 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ldb2O55203 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ldb2O55203 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ldb2O55203 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ldb2O55203 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ldb2O55203 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Ldb2O55203 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Ldb2O55203 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Ldb2O55203 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ldb2O55203 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ldb2O55203 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ldb2O55203 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ldb2O55203 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ldb2O55203 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ldb2O55203 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ldb2O55203 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ldb2O55203 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ldb2O55203 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Ldb2O55203 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ldb2O55203 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ldb2O55203 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ldb2O55203 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ldb2O55203 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ldb2O55203 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ldb2O55203 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ldb2O55203 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ldb2O55203 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ldb2O55203 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ldb2O55203 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ldb2O55203 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ldb2O55203 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ldb2O55203 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ldb2O55203 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ldb2O55203 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Ldb2O55203 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ldb2O55203 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
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Ldb2O55203 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ldb2O55203 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ldb2O55203 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ldb2O55203 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ldb2O55203 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ldb2O55203 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ldb2O55203 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ldb2O55203 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ldb2O55203 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ldb2O55203 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ldb2O55203 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ldb2O55203 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Ldb2O55203 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ldb2O55203 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ldb2O55203 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Ldb2O55203 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Ldb2O55203 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ldb2O55203 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Ldb2O55203 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ldb2O55203 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Ldb2O55203 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ldb2O55203 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ldb2O55203 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Ldb2O55203 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ldb2O55203 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ldb2O55203 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ldb2O55203 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms