Protein–RNA interactions for Protein: O55082

Ptpn20, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 20, mousemouse

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Length 426 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn20O55082 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ptpn20O55082 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Ptpn20O55082 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Ptpn20O55082 Gm44487-201ENSMUST00000205145 325 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Ptpn20O55082 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ptpn20O55082 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ptpn20O55082 Cd300lg-201ENSMUST00000017453 2353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ptpn20O55082 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ptpn20O55082 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Ptpn20O55082 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ptpn20O55082 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
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Ptpn20O55082 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ptpn20O55082 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ptpn20O55082 Corin-207ENSMUST00000177290 2943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Ptpn20O55082 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Ptpn20O55082 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ptpn20O55082 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ptpn20O55082 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ptpn20O55082 Gaa-201ENSMUST00000026666 3363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ptpn20O55082 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ptpn20O55082 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ptpn20O55082 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ptpn20O55082 Mmel1-202ENSMUST00000080559 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Ptpn20O55082 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
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Ptpn20O55082 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
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Ptpn20O55082 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
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Ptpn20O55082 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
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Ptpn20O55082 Wdr13-201ENSMUST00000033506 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
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Ptpn20O55082 Ces5a-203ENSMUST00000212009 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ptpn20O55082 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ptpn20O55082 Tdrd3-202ENSMUST00000168275 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ptpn20O55082 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Ptpn20O55082 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ptpn20O55082 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ptpn20O55082 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ptpn20O55082 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ptpn20O55082 Bub3-203ENSMUST00000207442 3414 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ptpn20O55082 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ptpn20O55082 Sgk2-201ENSMUST00000018012 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ptpn20O55082 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ptpn20O55082 Sass6-204ENSMUST00000197335 2458 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Ptpn20O55082 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ptpn20O55082 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ptpn20O55082 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ptpn20O55082 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ptpn20O55082 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ptpn20O55082 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ptpn20O55082 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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