Protein–RNA interactions for Protein: O54786

Dffa, DNA fragmentation factor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DffaO54786 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
DffaO54786 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
DffaO54786 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
DffaO54786 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
DffaO54786 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
DffaO54786 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
DffaO54786 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
DffaO54786 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
DffaO54786 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
DffaO54786 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
DffaO54786 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
DffaO54786 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
DffaO54786 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
DffaO54786 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
DffaO54786 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
DffaO54786 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
DffaO54786 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
DffaO54786 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
DffaO54786 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
DffaO54786 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
DffaO54786 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
DffaO54786 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
DffaO54786 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
DffaO54786 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
DffaO54786 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
DffaO54786 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
DffaO54786 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
DffaO54786 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
DffaO54786 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
DffaO54786 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
DffaO54786 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
DffaO54786 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
DffaO54786 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
DffaO54786 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
DffaO54786 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
DffaO54786 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
DffaO54786 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
DffaO54786 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
DffaO54786 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
DffaO54786 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
DffaO54786 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
DffaO54786 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
DffaO54786 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
DffaO54786 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
DffaO54786 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
DffaO54786 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
DffaO54786 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
DffaO54786 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
DffaO54786 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
DffaO54786 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
DffaO54786 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
DffaO54786 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
DffaO54786 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
DffaO54786 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
DffaO54786 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
DffaO54786 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
DffaO54786 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.22
DffaO54786 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
DffaO54786 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
DffaO54786 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
DffaO54786 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
DffaO54786 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
DffaO54786 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
DffaO54786 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
DffaO54786 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
DffaO54786 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
DffaO54786 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
DffaO54786 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
DffaO54786 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
DffaO54786 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
DffaO54786 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
DffaO54786 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
DffaO54786 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
DffaO54786 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
DffaO54786 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
DffaO54786 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
DffaO54786 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
DffaO54786 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
DffaO54786 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
DffaO54786 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
DffaO54786 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
DffaO54786 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
DffaO54786 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
DffaO54786 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
DffaO54786 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
DffaO54786 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
DffaO54786 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
DffaO54786 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
DffaO54786 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
DffaO54786 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
DffaO54786 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
DffaO54786 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
DffaO54786 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
DffaO54786 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
DffaO54786 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
DffaO54786 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
DffaO54786 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
DffaO54786 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
DffaO54786 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
DffaO54786 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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