Protein–RNA interactions for Protein: O35892

Sp100, Nuclear autoantigen Sp-100, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Sp100O35892 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sp100O35892 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sp100O35892 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sp100O35892 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
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Sp100O35892 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
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Sp100O35892 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
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Sp100O35892 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
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Sp100O35892 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sp100O35892 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sp100O35892 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sp100O35892 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
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Sp100O35892 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Sp100O35892 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Sp100O35892 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Sp100O35892 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
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Sp100O35892 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
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Sp100O35892 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
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Sp100O35892 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
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Sp100O35892 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Sp100O35892 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
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Sp100O35892 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Sp100O35892 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Sp100O35892 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
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Sp100O35892 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Sp100O35892 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Sp100O35892 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Sp100O35892 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Sp100O35892 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Sp100O35892 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Sp100O35892 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Sp100O35892 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Sp100O35892 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Sp100O35892 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Sp100O35892 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Sp100O35892 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Sp100O35892 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Sp100O35892 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Sp100O35892 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Sp100O35892 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Sp100O35892 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Sp100O35892 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Sp100O35892 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Sp100O35892 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Sp100O35892 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Sp100O35892 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
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