Protein–RNA interactions for Protein: O35599

Opn1mw, Medium-wave-sensitive opsin 1, mousemouse

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Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn1mwO35599 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Opn1mwO35599 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Opn1mwO35599 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Opn1mwO35599 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Opn1mwO35599 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Opn1mwO35599 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Opn1mwO35599 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Opn1mwO35599 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Opn1mwO35599 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Opn1mwO35599 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Opn1mwO35599 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Opn1mwO35599 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Opn1mwO35599 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Opn1mwO35599 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Opn1mwO35599 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Opn1mwO35599 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Opn1mwO35599 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Opn1mwO35599 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Opn1mwO35599 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Opn1mwO35599 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Opn1mwO35599 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Opn1mwO35599 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Opn1mwO35599 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Opn1mwO35599 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Opn1mwO35599 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Opn1mwO35599 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Opn1mwO35599 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Opn1mwO35599 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Opn1mwO35599 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Opn1mwO35599 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Opn1mwO35599 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Opn1mwO35599 Gm22902-201ENSMUST00000158488 302 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Opn1mwO35599 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Opn1mwO35599 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Opn1mwO35599 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Opn1mwO35599 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Opn1mwO35599 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Opn1mwO35599 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Opn1mwO35599 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Opn1mwO35599 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Opn1mwO35599 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Opn1mwO35599 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Opn1mwO35599 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Opn1mwO35599 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Opn1mwO35599 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Opn1mwO35599 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Opn1mwO35599 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Opn1mwO35599 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Opn1mwO35599 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Opn1mwO35599 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Opn1mwO35599 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Opn1mwO35599 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Opn1mwO35599 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Opn1mwO35599 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Opn1mwO35599 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Opn1mwO35599 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Opn1mwO35599 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Opn1mwO35599 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Opn1mwO35599 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Opn1mwO35599 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Opn1mwO35599 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Opn1mwO35599 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Opn1mwO35599 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Opn1mwO35599 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Opn1mwO35599 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Opn1mwO35599 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Opn1mwO35599 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Opn1mwO35599 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Opn1mwO35599 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Opn1mwO35599 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Opn1mwO35599 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
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Opn1mwO35599 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Opn1mwO35599 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Opn1mwO35599 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Opn1mwO35599 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Opn1mwO35599 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Opn1mwO35599 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Opn1mwO35599 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Opn1mwO35599 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Opn1mwO35599 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Opn1mwO35599 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Opn1mwO35599 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Opn1mwO35599 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Opn1mwO35599 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Opn1mwO35599 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Opn1mwO35599 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Opn1mwO35599 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Opn1mwO35599 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Opn1mwO35599 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Opn1mwO35599 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Opn1mwO35599 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Opn1mwO35599 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Opn1mwO35599 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Opn1mwO35599 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Opn1mwO35599 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Opn1mwO35599 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Opn1mwO35599 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Opn1mwO35599 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Opn1mwO35599 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms