Protein–RNA interactions for Protein: O35449

Prrt1, Proline-rich transmembrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt1O35449 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Prrt1O35449 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Prrt1O35449 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Prrt1O35449 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Prrt1O35449 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Prrt1O35449 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Prrt1O35449 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Prrt1O35449 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Prrt1O35449 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Prrt1O35449 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Prrt1O35449 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Prrt1O35449 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Prrt1O35449 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Prrt1O35449 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Prrt1O35449 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Prrt1O35449 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Prrt1O35449 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Prrt1O35449 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Prrt1O35449 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Prrt1O35449 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Prrt1O35449 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Prrt1O35449 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Prrt1O35449 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Prrt1O35449 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Prrt1O35449 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Prrt1O35449 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Prrt1O35449 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Prrt1O35449 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Prrt1O35449 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Prrt1O35449 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Prrt1O35449 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Prrt1O35449 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Prrt1O35449 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Prrt1O35449 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Prrt1O35449 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Prrt1O35449 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Prrt1O35449 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Prrt1O35449 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Prrt1O35449 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Prrt1O35449 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Prrt1O35449 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Prrt1O35449 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Prrt1O35449 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Prrt1O35449 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Prrt1O35449 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Prrt1O35449 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Prrt1O35449 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Prrt1O35449 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Prrt1O35449 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Prrt1O35449 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Prrt1O35449 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Prrt1O35449 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Prrt1O35449 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Prrt1O35449 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Prrt1O35449 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Prrt1O35449 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Prrt1O35449 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Prrt1O35449 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Prrt1O35449 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Prrt1O35449 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Prrt1O35449 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Prrt1O35449 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Prrt1O35449 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Prrt1O35449 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Prrt1O35449 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Prrt1O35449 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Prrt1O35449 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Prrt1O35449 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Prrt1O35449 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Prrt1O35449 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Prrt1O35449 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Prrt1O35449 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Prrt1O35449 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Prrt1O35449 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Prrt1O35449 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Prrt1O35449 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Prrt1O35449 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Prrt1O35449 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Prrt1O35449 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Prrt1O35449 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Prrt1O35449 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Prrt1O35449 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Prrt1O35449 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Prrt1O35449 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Prrt1O35449 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Prrt1O35449 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Prrt1O35449 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Prrt1O35449 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Prrt1O35449 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Prrt1O35449 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Prrt1O35449 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Prrt1O35449 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Prrt1O35449 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Prrt1O35449 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Prrt1O35449 D030068K23Rik-201ENSMUST00000180382 2617 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Prrt1O35449 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Prrt1O35449 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Prrt1O35449 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Prrt1O35449 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Prrt1O35449 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms