Protein–RNA interactions for Protein: O19441

H2-Q1, Histocompatibility 2, Q region locus 1, mousemouse

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Q1O19441 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
H2-Q1O19441 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
H2-Q1O19441 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
H2-Q1O19441 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
H2-Q1O19441 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
H2-Q1O19441 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
H2-Q1O19441 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
H2-Q1O19441 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
H2-Q1O19441 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
H2-Q1O19441 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
H2-Q1O19441 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
H2-Q1O19441 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
H2-Q1O19441 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
H2-Q1O19441 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
H2-Q1O19441 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
H2-Q1O19441 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
H2-Q1O19441 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
H2-Q1O19441 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
H2-Q1O19441 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC12.62□□□□□ -0.39
H2-Q1O19441 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
H2-Q1O19441 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
H2-Q1O19441 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
H2-Q1O19441 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
H2-Q1O19441 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC12.62□□□□□ -0.39
H2-Q1O19441 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
H2-Q1O19441 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
H2-Q1O19441 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
H2-Q1O19441 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
H2-Q1O19441 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
H2-Q1O19441 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
H2-Q1O19441 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
H2-Q1O19441 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
H2-Q1O19441 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
H2-Q1O19441 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
H2-Q1O19441 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
H2-Q1O19441 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC12.61□□□□□ -0.39
H2-Q1O19441 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
H2-Q1O19441 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
H2-Q1O19441 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
H2-Q1O19441 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
H2-Q1O19441 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
H2-Q1O19441 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
H2-Q1O19441 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
H2-Q1O19441 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
H2-Q1O19441 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
H2-Q1O19441 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
H2-Q1O19441 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
H2-Q1O19441 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
H2-Q1O19441 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
H2-Q1O19441 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
H2-Q1O19441 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
H2-Q1O19441 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
H2-Q1O19441 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
H2-Q1O19441 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
H2-Q1O19441 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
H2-Q1O19441 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
H2-Q1O19441 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
H2-Q1O19441 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
H2-Q1O19441 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
H2-Q1O19441 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
H2-Q1O19441 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
H2-Q1O19441 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
H2-Q1O19441 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
H2-Q1O19441 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
H2-Q1O19441 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
H2-Q1O19441 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
H2-Q1O19441 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
H2-Q1O19441 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
H2-Q1O19441 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
H2-Q1O19441 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
H2-Q1O19441 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
H2-Q1O19441 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
H2-Q1O19441 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
H2-Q1O19441 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
H2-Q1O19441 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
H2-Q1O19441 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
H2-Q1O19441 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
H2-Q1O19441 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
H2-Q1O19441 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
H2-Q1O19441 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
H2-Q1O19441 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
H2-Q1O19441 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
H2-Q1O19441 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
H2-Q1O19441 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC12.6□□□□□ -0.39
H2-Q1O19441 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
H2-Q1O19441 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
H2-Q1O19441 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
H2-Q1O19441 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
H2-Q1O19441 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
H2-Q1O19441 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
H2-Q1O19441 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
H2-Q1O19441 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
H2-Q1O19441 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
H2-Q1O19441 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
H2-Q1O19441 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
H2-Q1O19441 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
H2-Q1O19441 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
H2-Q1O19441 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
H2-Q1O19441 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
H2-Q1O19441 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms