Protein–RNA interactions for Protein: O08810

Eftud2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 971 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eftud2O08810 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Eftud2O08810 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Eftud2O08810 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Eftud2O08810 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Eftud2O08810 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Eftud2O08810 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Eftud2O08810 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Eftud2O08810 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Eftud2O08810 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Eftud2O08810 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Eftud2O08810 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Eftud2O08810 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Eftud2O08810 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Eftud2O08810 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Eftud2O08810 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Eftud2O08810 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Eftud2O08810 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Eftud2O08810 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Eftud2O08810 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Eftud2O08810 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Eftud2O08810 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Eftud2O08810 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Eftud2O08810 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Eftud2O08810 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Eftud2O08810 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Eftud2O08810 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Eftud2O08810 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Eftud2O08810 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Eftud2O08810 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Eftud2O08810 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Eftud2O08810 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Eftud2O08810 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Eftud2O08810 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Eftud2O08810 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Eftud2O08810 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Eftud2O08810 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Eftud2O08810 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Eftud2O08810 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Eftud2O08810 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Eftud2O08810 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Eftud2O08810 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Eftud2O08810 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Eftud2O08810 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Eftud2O08810 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Eftud2O08810 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Eftud2O08810 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Eftud2O08810 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Eftud2O08810 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Eftud2O08810 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Eftud2O08810 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Eftud2O08810 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Eftud2O08810 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Eftud2O08810 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Eftud2O08810 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Eftud2O08810 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Eftud2O08810 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Eftud2O08810 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Eftud2O08810 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Eftud2O08810 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Eftud2O08810 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Eftud2O08810 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Eftud2O08810 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Eftud2O08810 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Eftud2O08810 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Eftud2O08810 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Eftud2O08810 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Eftud2O08810 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Eftud2O08810 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Eftud2O08810 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Eftud2O08810 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Eftud2O08810 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Eftud2O08810 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Eftud2O08810 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Eftud2O08810 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Eftud2O08810 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Eftud2O08810 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Eftud2O08810 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Eftud2O08810 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Eftud2O08810 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Eftud2O08810 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Eftud2O08810 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Eftud2O08810 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Eftud2O08810 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Eftud2O08810 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Eftud2O08810 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Eftud2O08810 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Eftud2O08810 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Eftud2O08810 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Eftud2O08810 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Eftud2O08810 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Eftud2O08810 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Eftud2O08810 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Eftud2O08810 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Eftud2O08810 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Eftud2O08810 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Eftud2O08810 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Eftud2O08810 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Eftud2O08810 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Eftud2O08810 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Eftud2O08810 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.3 ms