Protein–RNA interactions for Protein: O08795

Prkcsh, Glucosidase 2 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcshO08795 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PrkcshO08795 Kpna7-202ENSMUST00000110673 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PrkcshO08795 Tnk2-207ENSMUST00000115126 4358 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PrkcshO08795 Prkag2-201ENSMUST00000030784 3331 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PrkcshO08795 Gm37759-201ENSMUST00000194155 3246 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PrkcshO08795 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PrkcshO08795 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PrkcshO08795 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PrkcshO08795 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PrkcshO08795 Kat6b-204ENSMUST00000182405 6977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PrkcshO08795 Gm45132-201ENSMUST00000207234 2542 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PrkcshO08795 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PrkcshO08795 Rnf2-201ENSMUST00000076110 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PrkcshO08795 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PrkcshO08795 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PrkcshO08795 Slc45a3-201ENSMUST00000027695 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PrkcshO08795 Mthfr-202ENSMUST00000097788 2652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PrkcshO08795 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PrkcshO08795 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PrkcshO08795 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PrkcshO08795 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PrkcshO08795 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PrkcshO08795 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PrkcshO08795 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PrkcshO08795 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PrkcshO08795 Gm8036-201ENSMUST00000118089 1718 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PrkcshO08795 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PrkcshO08795 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PrkcshO08795 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PrkcshO08795 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PrkcshO08795 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PrkcshO08795 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PrkcshO08795 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PrkcshO08795 Olfr169-203ENSMUST00000215476 2476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PrkcshO08795 Ldb3-202ENSMUST00000022328 2468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PrkcshO08795 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PrkcshO08795 Marveld2-201ENSMUST00000022137 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PrkcshO08795 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PrkcshO08795 Tnip1-203ENSMUST00000102731 2973 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PrkcshO08795 D930020B18Rik-201ENSMUST00000120642 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PrkcshO08795 Fhod1-201ENSMUST00000014922 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PrkcshO08795 2810032G03Rik-202ENSMUST00000163627 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PrkcshO08795 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PrkcshO08795 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PrkcshO08795 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PrkcshO08795 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PrkcshO08795 Rdh9-201ENSMUST00000052652 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PrkcshO08795 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PrkcshO08795 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PrkcshO08795 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PrkcshO08795 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PrkcshO08795 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PrkcshO08795 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PrkcshO08795 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PrkcshO08795 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PrkcshO08795 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PrkcshO08795 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PrkcshO08795 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PrkcshO08795 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PrkcshO08795 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PrkcshO08795 Sun1-205ENSMUST00000110883 3714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PrkcshO08795 Lrsam1-201ENSMUST00000028132 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PrkcshO08795 Nucks1-201ENSMUST00000062264 5998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PrkcshO08795 Plcd4-205ENSMUST00000113749 4648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PrkcshO08795 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PrkcshO08795 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PrkcshO08795 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PrkcshO08795 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PrkcshO08795 Angptl4-201ENSMUST00000002360 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PrkcshO08795 Pex19-202ENSMUST00000111252 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PrkcshO08795 Tmem74bos-202ENSMUST00000149319 2090 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PrkcshO08795 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PrkcshO08795 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PrkcshO08795 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PrkcshO08795 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PrkcshO08795 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PrkcshO08795 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PrkcshO08795 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PrkcshO08795 Sh2d3c-202ENSMUST00000113242 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PrkcshO08795 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PrkcshO08795 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PrkcshO08795 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PrkcshO08795 Plscr3-203ENSMUST00000108633 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PrkcshO08795 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PrkcshO08795 Ipo4-201ENSMUST00000047131 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PrkcshO08795 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PrkcshO08795 Gm43817-201ENSMUST00000196459 2262 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PrkcshO08795 Ccdc96-201ENSMUST00000060100 3585 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PrkcshO08795 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PrkcshO08795 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PrkcshO08795 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PrkcshO08795 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PrkcshO08795 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PrkcshO08795 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PrkcshO08795 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PrkcshO08795 Gm43356-201ENSMUST00000196582 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PrkcshO08795 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PrkcshO08795 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PrkcshO08795 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PrkcshO08795 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms