Protein–RNA interactions for Protein: O08665

Sema3a, Semaphorin-3A, mousemouse

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Length 772 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema3aO08665 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sema3aO08665 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sema3aO08665 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sema3aO08665 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sema3aO08665 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sema3aO08665 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sema3aO08665 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sema3aO08665 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sema3aO08665 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sema3aO08665 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sema3aO08665 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sema3aO08665 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sema3aO08665 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sema3aO08665 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sema3aO08665 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sema3aO08665 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sema3aO08665 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sema3aO08665 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sema3aO08665 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Sema3aO08665 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sema3aO08665 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Sema3aO08665 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Sema3aO08665 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Sema3aO08665 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sema3aO08665 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sema3aO08665 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sema3aO08665 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sema3aO08665 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sema3aO08665 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sema3aO08665 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sema3aO08665 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sema3aO08665 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sema3aO08665 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sema3aO08665 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sema3aO08665 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sema3aO08665 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Sema3aO08665 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sema3aO08665 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sema3aO08665 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sema3aO08665 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sema3aO08665 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sema3aO08665 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sema3aO08665 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sema3aO08665 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sema3aO08665 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sema3aO08665 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sema3aO08665 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sema3aO08665 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sema3aO08665 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sema3aO08665 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sema3aO08665 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sema3aO08665 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sema3aO08665 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Sema3aO08665 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sema3aO08665 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sema3aO08665 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sema3aO08665 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sema3aO08665 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Sema3aO08665 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Sema3aO08665 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sema3aO08665 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sema3aO08665 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Sema3aO08665 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Sema3aO08665 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sema3aO08665 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sema3aO08665 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sema3aO08665 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sema3aO08665 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sema3aO08665 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sema3aO08665 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Sema3aO08665 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sema3aO08665 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sema3aO08665 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sema3aO08665 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sema3aO08665 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sema3aO08665 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sema3aO08665 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sema3aO08665 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sema3aO08665 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sema3aO08665 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sema3aO08665 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sema3aO08665 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sema3aO08665 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sema3aO08665 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sema3aO08665 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sema3aO08665 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sema3aO08665 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sema3aO08665 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sema3aO08665 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sema3aO08665 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sema3aO08665 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sema3aO08665 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Sema3aO08665 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sema3aO08665 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Sema3aO08665 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sema3aO08665 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sema3aO08665 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Sema3aO08665 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Sema3aO08665 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sema3aO08665 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
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