Protein–RNA interactions for Protein: O08540

Msmb, Beta-microseminoprotein, mousemouse

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MsmbO08540 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
MsmbO08540 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
MsmbO08540 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
MsmbO08540 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
MsmbO08540 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
MsmbO08540 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
MsmbO08540 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
MsmbO08540 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
MsmbO08540 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
MsmbO08540 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
MsmbO08540 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
MsmbO08540 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
MsmbO08540 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
MsmbO08540 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
MsmbO08540 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
MsmbO08540 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
MsmbO08540 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
MsmbO08540 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
MsmbO08540 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
MsmbO08540 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
MsmbO08540 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
MsmbO08540 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
MsmbO08540 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
MsmbO08540 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
MsmbO08540 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
MsmbO08540 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
MsmbO08540 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
MsmbO08540 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
MsmbO08540 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
MsmbO08540 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
MsmbO08540 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
MsmbO08540 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
MsmbO08540 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
MsmbO08540 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
MsmbO08540 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
MsmbO08540 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
MsmbO08540 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
MsmbO08540 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
MsmbO08540 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
MsmbO08540 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
MsmbO08540 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
MsmbO08540 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
MsmbO08540 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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MsmbO08540 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
MsmbO08540 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
MsmbO08540 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
MsmbO08540 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
MsmbO08540 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
MsmbO08540 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
MsmbO08540 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
MsmbO08540 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
MsmbO08540 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
MsmbO08540 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
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MsmbO08540 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
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MsmbO08540 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
MsmbO08540 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
MsmbO08540 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
MsmbO08540 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
MsmbO08540 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
MsmbO08540 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
MsmbO08540 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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MsmbO08540 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
MsmbO08540 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
MsmbO08540 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
MsmbO08540 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
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MsmbO08540 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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MsmbO08540 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
MsmbO08540 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
MsmbO08540 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
MsmbO08540 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
MsmbO08540 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
MsmbO08540 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
MsmbO08540 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
MsmbO08540 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
MsmbO08540 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
MsmbO08540 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
MsmbO08540 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
MsmbO08540 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
MsmbO08540 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
MsmbO08540 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
MsmbO08540 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
MsmbO08540 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
MsmbO08540 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
MsmbO08540 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
MsmbO08540 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
MsmbO08540 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
MsmbO08540 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
MsmbO08540 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
MsmbO08540 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
MsmbO08540 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
MsmbO08540 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
MsmbO08540 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
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