Protein–RNA interactions for Protein: L7N2D2

Gm3278, Predicted gene 3278, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3278L7N2D2 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3278L7N2D2 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3278L7N2D2 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3278L7N2D2 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3278L7N2D2 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3278L7N2D2 Etv1-211ENSMUST00000162563 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3278L7N2D2 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3278L7N2D2 Apoo-202ENSMUST00000113896 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3278L7N2D2 Itpr3os-201ENSMUST00000143605 794 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3278L7N2D2 H1foo-203ENSMUST00000161969 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3278L7N2D2 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3278L7N2D2 Slc2a4rg-ps-202ENSMUST00000176590 1143 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3278L7N2D2 Stpg4-202ENSMUST00000186211 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3278L7N2D2 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3278L7N2D2 1700030I03Rik-201ENSMUST00000192978 942 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3278L7N2D2 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3278L7N2D2 4930447N08Rik-203ENSMUST00000198879 1157 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3278L7N2D2 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3278L7N2D2 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3278L7N2D2 Gm11938-201ENSMUST00000072306 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3278L7N2D2 Gm4950-201ENSMUST00000091905 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3278L7N2D2 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3278L7N2D2 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3278L7N2D2 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3278L7N2D2 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3278L7N2D2 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3278L7N2D2 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3278L7N2D2 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3278L7N2D2 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3278L7N2D2 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3278L7N2D2 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3278L7N2D2 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3278L7N2D2 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3278L7N2D2 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3278L7N2D2 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3278L7N2D2 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3278L7N2D2 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm3278L7N2D2 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm3278L7N2D2 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm3278L7N2D2 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm3278L7N2D2 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm3278L7N2D2 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm3278L7N2D2 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm3278L7N2D2 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm3278L7N2D2 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm3278L7N2D2 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm3278L7N2D2 Gm11675-201ENSMUST00000121873 832 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm3278L7N2D2 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm3278L7N2D2 Gm9358-201ENSMUST00000183067 927 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm3278L7N2D2 Insig2-214ENSMUST00000186915 674 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm3278L7N2D2 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm3278L7N2D2 Gm38210-201ENSMUST00000191944 809 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm3278L7N2D2 Olfr567-ps1-201ENSMUST00000210349 857 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm3278L7N2D2 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm3278L7N2D2 Cmtm2a-201ENSMUST00000034344 1081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm3278L7N2D2 Krtap19-9b-201ENSMUST00000077715 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm3278L7N2D2 Nceh1-202ENSMUST00000091284 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm3278L7N2D2 Srsf5-202ENSMUST00000110351 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm3278L7N2D2 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm3278L7N2D2 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm3278L7N2D2 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm3278L7N2D2 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm3278L7N2D2 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm3278L7N2D2 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm3278L7N2D2 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm3278L7N2D2 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm3278L7N2D2 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm3278L7N2D2 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm3278L7N2D2 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm3278L7N2D2 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm3278L7N2D2 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm3278L7N2D2 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm3278L7N2D2 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm3278L7N2D2 Gm12798-201ENSMUST00000124786 666 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm3278L7N2D2 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm3278L7N2D2 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm3278L7N2D2 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm3278L7N2D2 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm3278L7N2D2 Rn7s6-201ENSMUST00000175005 291 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm3278L7N2D2 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm3278L7N2D2 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm3278L7N2D2 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm3278L7N2D2 C330004P14Rik-201ENSMUST00000218833 628 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm3278L7N2D2 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm3278L7N2D2 AC099645.1-201ENSMUST00000226476 1105 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm3278L7N2D2 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm3278L7N2D2 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm3278L7N2D2 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm3278L7N2D2 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm3278L7N2D2 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm3278L7N2D2 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm3278L7N2D2 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm3278L7N2D2 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm3278L7N2D2 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm3278L7N2D2 4930523C07Rik-202ENSMUST00000097513 300 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm3278L7N2D2 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm3278L7N2D2 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm3278L7N2D2 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm3278L7N2D2 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm3278L7N2D2 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.6 ms