Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ02

Gm2056, Predicted gene 2056, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2056J3QQ02 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Gm2056J3QQ02 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Gm2056J3QQ02 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Gm2056J3QQ02 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Gm2056J3QQ02 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Gm2056J3QQ02 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Gm2056J3QQ02 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Gm2056J3QQ02 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Gm2056J3QQ02 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Gm2056J3QQ02 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Gm2056J3QQ02 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Gm2056J3QQ02 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Gm2056J3QQ02 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC12.46□□□□□ -0.42
Gm2056J3QQ02 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm2056J3QQ02 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm2056J3QQ02 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm2056J3QQ02 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm2056J3QQ02 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm2056J3QQ02 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm2056J3QQ02 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm2056J3QQ02 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm2056J3QQ02 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm2056J3QQ02 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm2056J3QQ02 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm2056J3QQ02 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm2056J3QQ02 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm2056J3QQ02 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm2056J3QQ02 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm2056J3QQ02 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm2056J3QQ02 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm2056J3QQ02 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm2056J3QQ02 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm2056J3QQ02 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm2056J3QQ02 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm2056J3QQ02 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm2056J3QQ02 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm2056J3QQ02 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm2056J3QQ02 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm2056J3QQ02 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm2056J3QQ02 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm2056J3QQ02 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm2056J3QQ02 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm2056J3QQ02 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm2056J3QQ02 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm2056J3QQ02 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm2056J3QQ02 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm2056J3QQ02 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm2056J3QQ02 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm2056J3QQ02 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm2056J3QQ02 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm2056J3QQ02 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm2056J3QQ02 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm2056J3QQ02 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm2056J3QQ02 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm2056J3QQ02 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm2056J3QQ02 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm2056J3QQ02 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm2056J3QQ02 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm2056J3QQ02 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm2056J3QQ02 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm2056J3QQ02 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm2056J3QQ02 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm2056J3QQ02 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm2056J3QQ02 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm2056J3QQ02 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm2056J3QQ02 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm2056J3QQ02 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm2056J3QQ02 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm2056J3QQ02 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm2056J3QQ02 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm2056J3QQ02 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm2056J3QQ02 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm2056J3QQ02 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm2056J3QQ02 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm2056J3QQ02 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm2056J3QQ02 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm2056J3QQ02 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm2056J3QQ02 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm2056J3QQ02 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm2056J3QQ02 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm2056J3QQ02 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm2056J3QQ02 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm2056J3QQ02 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm2056J3QQ02 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm2056J3QQ02 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm2056J3QQ02 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm2056J3QQ02 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm2056J3QQ02 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm2056J3QQ02 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm2056J3QQ02 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm2056J3QQ02 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm2056J3QQ02 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm2056J3QQ02 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm2056J3QQ02 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm2056J3QQ02 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm2056J3QQ02 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm2056J3QQ02 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm2056J3QQ02 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm2056J3QQ02 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm2056J3QQ02 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms