Protein–RNA interactions for Protein: J3QPC1

Gm933, Predicted gene 933, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm933J3QPC1 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm933J3QPC1 Tex30-201ENSMUST00000027215 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm933J3QPC1 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm933J3QPC1 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm933J3QPC1 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm933J3QPC1 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm933J3QPC1 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm933J3QPC1 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm933J3QPC1 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm933J3QPC1 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm933J3QPC1 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm933J3QPC1 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm933J3QPC1 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm933J3QPC1 Nrf1-219ENSMUST00000167972 1541 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm933J3QPC1 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm933J3QPC1 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm933J3QPC1 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm933J3QPC1 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm933J3QPC1 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm933J3QPC1 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
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Gm933J3QPC1 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm933J3QPC1 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm933J3QPC1 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm933J3QPC1 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm933J3QPC1 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm933J3QPC1 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm933J3QPC1 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm933J3QPC1 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm933J3QPC1 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm933J3QPC1 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm933J3QPC1 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm933J3QPC1 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm933J3QPC1 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm933J3QPC1 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm933J3QPC1 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm933J3QPC1 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm933J3QPC1 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm933J3QPC1 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm933J3QPC1 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm933J3QPC1 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
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Gm933J3QPC1 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
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Gm933J3QPC1 Tmem190-201ENSMUST00000013235 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm933J3QPC1 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm933J3QPC1 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm933J3QPC1 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm933J3QPC1 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
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Gm933J3QPC1 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm933J3QPC1 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
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Gm933J3QPC1 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm933J3QPC1 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm933J3QPC1 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm933J3QPC1 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
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Gm933J3QPC1 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
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Gm933J3QPC1 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm933J3QPC1 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm933J3QPC1 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm933J3QPC1 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm933J3QPC1 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm933J3QPC1 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm933J3QPC1 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm933J3QPC1 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm933J3QPC1 Bbs5-202ENSMUST00000112286 1397 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm933J3QPC1 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm933J3QPC1 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm933J3QPC1 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm933J3QPC1 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm933J3QPC1 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm933J3QPC1 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm933J3QPC1 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm933J3QPC1 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm933J3QPC1 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm933J3QPC1 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm933J3QPC1 Gm13408-201ENSMUST00000119822 798 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm933J3QPC1 Gm13935-201ENSMUST00000121859 798 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm933J3QPC1 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm933J3QPC1 Gm16308-201ENSMUST00000162171 940 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm933J3QPC1 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm933J3QPC1 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm933J3QPC1 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm933J3QPC1 Timm10b-210ENSMUST00000209588 373 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
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