Protein–RNA interactions for Protein: J3QP38

Gm21900, Predicted gene, 21900, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21900J3QP38 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21900J3QP38 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21900J3QP38 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21900J3QP38 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21900J3QP38 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21900J3QP38 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21900J3QP38 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21900J3QP38 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21900J3QP38 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21900J3QP38 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21900J3QP38 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21900J3QP38 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21900J3QP38 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21900J3QP38 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21900J3QP38 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21900J3QP38 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21900J3QP38 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21900J3QP38 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21900J3QP38 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21900J3QP38 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21900J3QP38 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21900J3QP38 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21900J3QP38 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21900J3QP38 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21900J3QP38 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21900J3QP38 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21900J3QP38 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21900J3QP38 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21900J3QP38 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21900J3QP38 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21900J3QP38 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21900J3QP38 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21900J3QP38 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21900J3QP38 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21900J3QP38 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21900J3QP38 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21900J3QP38 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21900J3QP38 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21900J3QP38 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21900J3QP38 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21900J3QP38 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21900J3QP38 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21900J3QP38 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21900J3QP38 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21900J3QP38 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21900J3QP38 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21900J3QP38 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21900J3QP38 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21900J3QP38 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21900J3QP38 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21900J3QP38 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21900J3QP38 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21900J3QP38 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21900J3QP38 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21900J3QP38 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21900J3QP38 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21900J3QP38 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21900J3QP38 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21900J3QP38 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21900J3QP38 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21900J3QP38 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21900J3QP38 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21900J3QP38 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21900J3QP38 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21900J3QP38 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21900J3QP38 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21900J3QP38 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21900J3QP38 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21900J3QP38 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21900J3QP38 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21900J3QP38 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21900J3QP38 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21900J3QP38 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21900J3QP38 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21900J3QP38 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21900J3QP38 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21900J3QP38 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21900J3QP38 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21900J3QP38 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21900J3QP38 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21900J3QP38 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21900J3QP38 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21900J3QP38 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21900J3QP38 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21900J3QP38 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21900J3QP38 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21900J3QP38 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21900J3QP38 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21900J3QP38 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21900J3QP38 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21900J3QP38 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21900J3QP38 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21900J3QP38 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21900J3QP38 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21900J3QP38 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21900J3QP38 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21900J3QP38 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21900J3QP38 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21900J3QP38 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21900J3QP38 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms