Protein–RNA interactions for Protein: J3QP37

Smim22, MCG1038270, isoform CRA_a, mousemouse

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Length 91 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim22J3QP37 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smim22J3QP37 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smim22J3QP37 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smim22J3QP37 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smim22J3QP37 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smim22J3QP37 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smim22J3QP37 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smim22J3QP37 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smim22J3QP37 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smim22J3QP37 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smim22J3QP37 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smim22J3QP37 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smim22J3QP37 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smim22J3QP37 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smim22J3QP37 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smim22J3QP37 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smim22J3QP37 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smim22J3QP37 2610301B20Rik-202ENSMUST00000101504 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smim22J3QP37 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smim22J3QP37 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smim22J3QP37 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smim22J3QP37 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smim22J3QP37 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smim22J3QP37 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smim22J3QP37 Rbm3-205ENSMUST00000115619 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smim22J3QP37 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smim22J3QP37 Gm13965-201ENSMUST00000154834 576 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smim22J3QP37 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Smim22J3QP37 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smim22J3QP37 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smim22J3QP37 Gm6644-201ENSMUST00000186507 951 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Smim22J3QP37 Gm37592-201ENSMUST00000192741 373 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smim22J3QP37 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smim22J3QP37 2610318N02Rik-202ENSMUST00000207116 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smim22J3QP37 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Smim22J3QP37 Gm45481-201ENSMUST00000209717 877 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Smim22J3QP37 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smim22J3QP37 AC121357.1-201ENSMUST00000227365 608 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Smim22J3QP37 Aimp1-201ENSMUST00000029663 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smim22J3QP37 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Smim22J3QP37 Gm11938-201ENSMUST00000072306 663 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smim22J3QP37 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smim22J3QP37 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smim22J3QP37 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smim22J3QP37 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smim22J3QP37 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smim22J3QP37 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smim22J3QP37 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smim22J3QP37 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smim22J3QP37 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smim22J3QP37 AC137950.2-202ENSMUST00000227150 1635 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Smim22J3QP37 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smim22J3QP37 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smim22J3QP37 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smim22J3QP37 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smim22J3QP37 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smim22J3QP37 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smim22J3QP37 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smim22J3QP37 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smim22J3QP37 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smim22J3QP37 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smim22J3QP37 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smim22J3QP37 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smim22J3QP37 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smim22J3QP37 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smim22J3QP37 Gm17193-201ENSMUST00000116345 691 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smim22J3QP37 Gm12419-201ENSMUST00000116649 636 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Smim22J3QP37 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Smim22J3QP37 Gm13700-201ENSMUST00000118624 1128 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Smim22J3QP37 Gm13008-201ENSMUST00000142289 507 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smim22J3QP37 Nop16-202ENSMUST00000148222 790 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smim22J3QP37 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smim22J3QP37 Gm15978-201ENSMUST00000161043 738 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smim22J3QP37 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smim22J3QP37 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smim22J3QP37 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smim22J3QP37 Mmp7-201ENSMUST00000018767 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smim22J3QP37 Shisa5-205ENSMUST00000197099 742 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smim22J3QP37 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smim22J3QP37 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Smim22J3QP37 Olfr354-201ENSMUST00000068475 1084 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smim22J3QP37 Prss55-201ENSMUST00000089338 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smim22J3QP37 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smim22J3QP37 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smim22J3QP37 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smim22J3QP37 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smim22J3QP37 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smim22J3QP37 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smim22J3QP37 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smim22J3QP37 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smim22J3QP37 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smim22J3QP37 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smim22J3QP37 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smim22J3QP37 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smim22J3QP37 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smim22J3QP37 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smim22J3QP37 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smim22J3QP37 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smim22J3QP37 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smim22J3QP37 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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