Protein–RNA interactions for Protein: G5E8Z2

Taf4b, Transcription initiation factor TFIID subunit 4B, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf4bG5E8Z2 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Taf4bG5E8Z2 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Taf4bG5E8Z2 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Taf4bG5E8Z2 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Taf4bG5E8Z2 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Taf4bG5E8Z2 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Taf4bG5E8Z2 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Taf4bG5E8Z2 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Taf4bG5E8Z2 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Taf4bG5E8Z2 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Taf4bG5E8Z2 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Taf4bG5E8Z2 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Taf4bG5E8Z2 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Taf4bG5E8Z2 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Taf4bG5E8Z2 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Taf4bG5E8Z2 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Taf4bG5E8Z2 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Taf4bG5E8Z2 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Taf4bG5E8Z2 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Taf4bG5E8Z2 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Taf4bG5E8Z2 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Taf4bG5E8Z2 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Taf4bG5E8Z2 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Taf4bG5E8Z2 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Taf4bG5E8Z2 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Taf4bG5E8Z2 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Taf4bG5E8Z2 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Taf4bG5E8Z2 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Taf4bG5E8Z2 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Taf4bG5E8Z2 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Taf4bG5E8Z2 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Taf4bG5E8Z2 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Taf4bG5E8Z2 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Taf4bG5E8Z2 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Taf4bG5E8Z2 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Taf4bG5E8Z2 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Taf4bG5E8Z2 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Taf4bG5E8Z2 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Taf4bG5E8Z2 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Taf4bG5E8Z2 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Taf4bG5E8Z2 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Taf4bG5E8Z2 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Taf4bG5E8Z2 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Taf4bG5E8Z2 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Taf4bG5E8Z2 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Taf4bG5E8Z2 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Taf4bG5E8Z2 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Taf4bG5E8Z2 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Taf4bG5E8Z2 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Taf4bG5E8Z2 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Taf4bG5E8Z2 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Taf4bG5E8Z2 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Taf4bG5E8Z2 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Taf4bG5E8Z2 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Taf4bG5E8Z2 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Taf4bG5E8Z2 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Taf4bG5E8Z2 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Taf4bG5E8Z2 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Taf4bG5E8Z2 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Taf4bG5E8Z2 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Taf4bG5E8Z2 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Taf4bG5E8Z2 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Taf4bG5E8Z2 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Taf4bG5E8Z2 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Taf4bG5E8Z2 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Taf4bG5E8Z2 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Taf4bG5E8Z2 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Taf4bG5E8Z2 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Taf4bG5E8Z2 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
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Taf4bG5E8Z2 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Taf4bG5E8Z2 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Taf4bG5E8Z2 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Taf4bG5E8Z2 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Taf4bG5E8Z2 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Taf4bG5E8Z2 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Taf4bG5E8Z2 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Taf4bG5E8Z2 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Taf4bG5E8Z2 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Taf4bG5E8Z2 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Taf4bG5E8Z2 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Taf4bG5E8Z2 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Taf4bG5E8Z2 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Taf4bG5E8Z2 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Taf4bG5E8Z2 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Taf4bG5E8Z2 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Taf4bG5E8Z2 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Taf4bG5E8Z2 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Taf4bG5E8Z2 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Taf4bG5E8Z2 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Taf4bG5E8Z2 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Taf4bG5E8Z2 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Taf4bG5E8Z2 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Taf4bG5E8Z2 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Taf4bG5E8Z2 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Taf4bG5E8Z2 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Taf4bG5E8Z2 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Taf4bG5E8Z2 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Taf4bG5E8Z2 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Taf4bG5E8Z2 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
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