Protein–RNA interactions for Protein: G3UW71

Vmn1r167, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r167G3UW71 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Vmn1r167G3UW71 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Vmn1r167G3UW71 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Vmn1r167G3UW71 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Vmn1r167G3UW71 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Vmn1r167G3UW71 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Vmn1r167G3UW71 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Vmn1r167G3UW71 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Vmn1r167G3UW71 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Vmn1r167G3UW71 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Vmn1r167G3UW71 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Vmn1r167G3UW71 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vmn1r167G3UW71 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vmn1r167G3UW71 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vmn1r167G3UW71 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vmn1r167G3UW71 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vmn1r167G3UW71 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vmn1r167G3UW71 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vmn1r167G3UW71 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vmn1r167G3UW71 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vmn1r167G3UW71 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vmn1r167G3UW71 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vmn1r167G3UW71 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vmn1r167G3UW71 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vmn1r167G3UW71 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vmn1r167G3UW71 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vmn1r167G3UW71 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vmn1r167G3UW71 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vmn1r167G3UW71 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vmn1r167G3UW71 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vmn1r167G3UW71 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vmn1r167G3UW71 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Vmn1r167G3UW71 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vmn1r167G3UW71 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Vmn1r167G3UW71 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vmn1r167G3UW71 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vmn1r167G3UW71 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Vmn1r167G3UW71 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Vmn1r167G3UW71 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
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Vmn1r167G3UW71 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Vmn1r167G3UW71 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vmn1r167G3UW71 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vmn1r167G3UW71 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vmn1r167G3UW71 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Vmn1r167G3UW71 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Vmn1r167G3UW71 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vmn1r167G3UW71 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vmn1r167G3UW71 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Vmn1r167G3UW71 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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Vmn1r167G3UW71 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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Vmn1r167G3UW71 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vmn1r167G3UW71 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
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Vmn1r167G3UW71 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vmn1r167G3UW71 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Vmn1r167G3UW71 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vmn1r167G3UW71 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vmn1r167G3UW71 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vmn1r167G3UW71 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vmn1r167G3UW71 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vmn1r167G3UW71 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vmn1r167G3UW71 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vmn1r167G3UW71 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vmn1r167G3UW71 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vmn1r167G3UW71 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vmn1r167G3UW71 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vmn1r167G3UW71 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vmn1r167G3UW71 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vmn1r167G3UW71 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vmn1r167G3UW71 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vmn1r167G3UW71 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Vmn1r167G3UW71 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vmn1r167G3UW71 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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