Protein–RNA interactions for Protein: F8VQC1

Srp72, Signal recognition particle subunit SRP72, mousemouse

Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp72F8VQC1 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Srp72F8VQC1 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Srp72F8VQC1 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Srp72F8VQC1 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Srp72F8VQC1 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Srp72F8VQC1 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Srp72F8VQC1 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Srp72F8VQC1 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Srp72F8VQC1 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Srp72F8VQC1 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Srp72F8VQC1 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Srp72F8VQC1 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Srp72F8VQC1 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Srp72F8VQC1 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Srp72F8VQC1 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Srp72F8VQC1 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Srp72F8VQC1 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Srp72F8VQC1 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Srp72F8VQC1 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Srp72F8VQC1 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Srp72F8VQC1 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Srp72F8VQC1 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Srp72F8VQC1 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Srp72F8VQC1 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Srp72F8VQC1 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Srp72F8VQC1 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Srp72F8VQC1 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Srp72F8VQC1 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Srp72F8VQC1 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Srp72F8VQC1 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Srp72F8VQC1 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Srp72F8VQC1 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Srp72F8VQC1 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Srp72F8VQC1 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Srp72F8VQC1 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Srp72F8VQC1 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Srp72F8VQC1 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Srp72F8VQC1 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Srp72F8VQC1 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Srp72F8VQC1 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Srp72F8VQC1 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Srp72F8VQC1 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Srp72F8VQC1 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Srp72F8VQC1 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Srp72F8VQC1 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Srp72F8VQC1 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Srp72F8VQC1 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Srp72F8VQC1 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Srp72F8VQC1 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Srp72F8VQC1 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Srp72F8VQC1 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Srp72F8VQC1 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Srp72F8VQC1 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Srp72F8VQC1 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Srp72F8VQC1 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Srp72F8VQC1 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Srp72F8VQC1 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Srp72F8VQC1 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Srp72F8VQC1 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Srp72F8VQC1 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Srp72F8VQC1 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Srp72F8VQC1 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Srp72F8VQC1 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Srp72F8VQC1 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Srp72F8VQC1 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Srp72F8VQC1 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Srp72F8VQC1 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Srp72F8VQC1 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Srp72F8VQC1 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Srp72F8VQC1 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Srp72F8VQC1 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Srp72F8VQC1 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Srp72F8VQC1 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Srp72F8VQC1 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Srp72F8VQC1 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Srp72F8VQC1 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Srp72F8VQC1 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Srp72F8VQC1 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Srp72F8VQC1 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Srp72F8VQC1 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Srp72F8VQC1 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Srp72F8VQC1 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Srp72F8VQC1 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Srp72F8VQC1 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Srp72F8VQC1 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Srp72F8VQC1 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Srp72F8VQC1 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Srp72F8VQC1 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Srp72F8VQC1 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Srp72F8VQC1 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Srp72F8VQC1 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Srp72F8VQC1 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Srp72F8VQC1 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Srp72F8VQC1 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Srp72F8VQC1 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Srp72F8VQC1 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Srp72F8VQC1 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Srp72F8VQC1 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Srp72F8VQC1 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Srp72F8VQC1 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms