Protein–RNA interactions for Protein: F6Z9R1

Gm20538, Predicted gene 20538 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 75 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20538F6Z9R1 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Gm20538F6Z9R1 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Gm20538F6Z9R1 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
Gm20538F6Z9R1 Brat1-201ENSMUST00000041588 3333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Gm20538F6Z9R1 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Gm20538F6Z9R1 Bcorl1-201ENSMUST00000037596 7360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Gm20538F6Z9R1 Gm30373-201ENSMUST00000215774 3500 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Gm20538F6Z9R1 Gm28955-201ENSMUST00000188167 2166 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Gm20538F6Z9R1 Sept9-202ENSMUST00000093907 3616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Gm20538F6Z9R1 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Gm20538F6Z9R1 Igf1-201ENSMUST00000062862 2292 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
Gm20538F6Z9R1 Rian-202ENSMUST00000181253 2355 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Gm20538F6Z9R1 Dnajc10-201ENSMUST00000028392 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Gm20538F6Z9R1 Star-201ENSMUST00000033979 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Gm20538F6Z9R1 Hdac7-204ENSMUST00000116409 4113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Gm20538F6Z9R1 Gm29326-201ENSMUST00000185541 2451 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Gm20538F6Z9R1 Alas1-202ENSMUST00000112524 3089 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Gm20538F6Z9R1 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Gm20538F6Z9R1 Gm28370-201ENSMUST00000185303 3375 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Gm20538F6Z9R1 Kcnk5-201ENSMUST00000024011 3392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Gm20538F6Z9R1 Gm19299-202ENSMUST00000215724 1435 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm20538F6Z9R1 Ttc1-201ENSMUST00000048578 1438 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm20538F6Z9R1 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm20538F6Z9R1 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm20538F6Z9R1 Ryr2-202ENSMUST00000170156 16813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm20538F6Z9R1 Ryr2-201ENSMUST00000021750 16814 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm20538F6Z9R1 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm20538F6Z9R1 Itih3-205ENSMUST00000227995 2100 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm20538F6Z9R1 Gpa33-204ENSMUST00000166860 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm20538F6Z9R1 5430401H09Rik-202ENSMUST00000218836 2620 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm20538F6Z9R1 Dab2-211ENSMUST00000161812 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm20538F6Z9R1 Zfyve1-201ENSMUST00000048319 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm20538F6Z9R1 Nek7-203ENSMUST00000187407 4336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm20538F6Z9R1 Pcdhgc5-201ENSMUST00000055935 4741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm20538F6Z9R1 Pm20d1-202ENSMUST00000112393 6900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm20538F6Z9R1 Zkscan2-201ENSMUST00000042470 7831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm20538F6Z9R1 Vmn1r86-202ENSMUST00000226604 6378 ntAPPRIS P2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm20538F6Z9R1 Gm44699-201ENSMUST00000208229 5083 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm20538F6Z9R1 Unkl-202ENSMUST00000039734 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm20538F6Z9R1 Lrrc71-201ENSMUST00000023846 3988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm20538F6Z9R1 Atg7-201ENSMUST00000032457 3761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm20538F6Z9R1 Atp2a1-201ENSMUST00000032974 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm20538F6Z9R1 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm20538F6Z9R1 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm20538F6Z9R1 Lrrc18-201ENSMUST00000038956 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm20538F6Z9R1 Fermt3-201ENSMUST00000040772 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm20538F6Z9R1 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm20538F6Z9R1 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm20538F6Z9R1 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm20538F6Z9R1 Ass1-201ENSMUST00000102840 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm20538F6Z9R1 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm20538F6Z9R1 Ces2d-ps-201ENSMUST00000043209 1656 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm20538F6Z9R1 Ppp6r3-201ENSMUST00000025846 4841 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm20538F6Z9R1 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm20538F6Z9R1 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm20538F6Z9R1 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm20538F6Z9R1 Adcy3-201ENSMUST00000020984 4348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm20538F6Z9R1 Gm5136-201ENSMUST00000218023 1397 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm20538F6Z9R1 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm20538F6Z9R1 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm20538F6Z9R1 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm20538F6Z9R1 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm20538F6Z9R1 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm20538F6Z9R1 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm20538F6Z9R1 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm20538F6Z9R1 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm20538F6Z9R1 Ccdc136-209ENSMUST00000181464 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm20538F6Z9R1 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm20538F6Z9R1 C030034L19Rik-203ENSMUST00000181930 3133 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm20538F6Z9R1 Ggcx-201ENSMUST00000065906 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm20538F6Z9R1 Tnfsf13b-203ENSMUST00000207792 4771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm20538F6Z9R1 Rufy2-204ENSMUST00000131718 2816 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm20538F6Z9R1 Pus7l-201ENSMUST00000049151 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm20538F6Z9R1 Ptprr-206ENSMUST00000148731 2511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm20538F6Z9R1 Gm37031-201ENSMUST00000195487 2530 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm20538F6Z9R1 Zfp410-208ENSMUST00000222258 2329 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm20538F6Z9R1 4933414I15Rik-201ENSMUST00000109123 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm20538F6Z9R1 Gm9860-201ENSMUST00000211426 3653 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm20538F6Z9R1 Rorc-201ENSMUST00000029795 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm20538F6Z9R1 Synm-203ENSMUST00000207102 3388 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm20538F6Z9R1 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm20538F6Z9R1 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm20538F6Z9R1 Gm38697-201ENSMUST00000198061 1746 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm20538F6Z9R1 Akap3-202ENSMUST00000202574 2879 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm20538F6Z9R1 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm20538F6Z9R1 Olfr119-202ENSMUST00000213732 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm20538F6Z9R1 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm20538F6Z9R1 Sorbs2-228ENSMUST00000153798 2667 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm20538F6Z9R1 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm20538F6Z9R1 Ano1-202ENSMUST00000118556 4566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm20538F6Z9R1 Lhx4-201ENSMUST00000027740 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm20538F6Z9R1 B230317F23Rik-201ENSMUST00000052189 2472 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm20538F6Z9R1 Golga2-203ENSMUST00000113377 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm20538F6Z9R1 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm20538F6Z9R1 Zfp114-201ENSMUST00000086010 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm20538F6Z9R1 Nup107-201ENSMUST00000064848 3114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm20538F6Z9R1 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm20538F6Z9R1 Otx2-210ENSMUST00000227404 2086 ntAPPRIS P1 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Gm20538F6Z9R1 Suclg2-204ENSMUST00000204224 3367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Gm20538F6Z9R1 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms