Protein–RNA interactions for Protein: F6YKY3

Gm8005, Predicted gene 8005 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8005F6YKY3 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Gm8005F6YKY3 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm8005F6YKY3 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm8005F6YKY3 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm8005F6YKY3 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm8005F6YKY3 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm8005F6YKY3 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm8005F6YKY3 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm8005F6YKY3 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm8005F6YKY3 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm8005F6YKY3 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm8005F6YKY3 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm8005F6YKY3 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm8005F6YKY3 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm8005F6YKY3 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm8005F6YKY3 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm8005F6YKY3 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm8005F6YKY3 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm8005F6YKY3 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm8005F6YKY3 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm8005F6YKY3 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm8005F6YKY3 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm8005F6YKY3 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm8005F6YKY3 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm8005F6YKY3 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm8005F6YKY3 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm8005F6YKY3 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm8005F6YKY3 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm8005F6YKY3 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm8005F6YKY3 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm8005F6YKY3 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm8005F6YKY3 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm8005F6YKY3 AC122291.1-201ENSMUST00000228937 5748 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm8005F6YKY3 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm8005F6YKY3 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm8005F6YKY3 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm8005F6YKY3 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm8005F6YKY3 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm8005F6YKY3 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm8005F6YKY3 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm8005F6YKY3 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm8005F6YKY3 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm8005F6YKY3 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm8005F6YKY3 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm8005F6YKY3 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm8005F6YKY3 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm8005F6YKY3 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm8005F6YKY3 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm8005F6YKY3 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm8005F6YKY3 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm8005F6YKY3 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm8005F6YKY3 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm8005F6YKY3 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm8005F6YKY3 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm8005F6YKY3 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm8005F6YKY3 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm8005F6YKY3 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm8005F6YKY3 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm8005F6YKY3 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm8005F6YKY3 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm8005F6YKY3 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm8005F6YKY3 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm8005F6YKY3 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm8005F6YKY3 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm8005F6YKY3 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm8005F6YKY3 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm8005F6YKY3 Sgk1-213ENSMUST00000164659 2602 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm8005F6YKY3 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm8005F6YKY3 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm8005F6YKY3 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm8005F6YKY3 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm8005F6YKY3 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm8005F6YKY3 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm8005F6YKY3 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm8005F6YKY3 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm8005F6YKY3 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm8005F6YKY3 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm8005F6YKY3 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm8005F6YKY3 Neurod6-201ENSMUST00000044767 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm8005F6YKY3 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm8005F6YKY3 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm8005F6YKY3 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm8005F6YKY3 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm8005F6YKY3 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm8005F6YKY3 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm8005F6YKY3 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm8005F6YKY3 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm8005F6YKY3 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm8005F6YKY3 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm8005F6YKY3 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm8005F6YKY3 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm8005F6YKY3 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm8005F6YKY3 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm8005F6YKY3 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm8005F6YKY3 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm8005F6YKY3 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm8005F6YKY3 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm8005F6YKY3 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm8005F6YKY3 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm8005F6YKY3 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
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