Protein–RNA interactions for Protein: F6YH22

Gm5218, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5218F6YH22 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Gm5218F6YH22 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Gm5218F6YH22 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Gm5218F6YH22 Erbin-201ENSMUST00000022222 6369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Gm5218F6YH22 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Gm5218F6YH22 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Gm5218F6YH22 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Gm5218F6YH22 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Gm5218F6YH22 Ehbp1-202ENSMUST00000109563 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Gm5218F6YH22 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Gm5218F6YH22 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Gm5218F6YH22 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Gm5218F6YH22 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm5218F6YH22 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm5218F6YH22 Magel2-201ENSMUST00000080403 4631 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm5218F6YH22 Sel1l-204ENSMUST00000167466 5544 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm5218F6YH22 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm5218F6YH22 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm5218F6YH22 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm5218F6YH22 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm5218F6YH22 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm5218F6YH22 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm5218F6YH22 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm5218F6YH22 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm5218F6YH22 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm5218F6YH22 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm5218F6YH22 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm5218F6YH22 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm5218F6YH22 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm5218F6YH22 Gm10545-201ENSMUST00000097612 4969 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm5218F6YH22 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm5218F6YH22 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm5218F6YH22 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm5218F6YH22 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm5218F6YH22 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm5218F6YH22 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm5218F6YH22 Slc36a1-203ENSMUST00000108872 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm5218F6YH22 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm5218F6YH22 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm5218F6YH22 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm5218F6YH22 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm5218F6YH22 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm5218F6YH22 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm5218F6YH22 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm5218F6YH22 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm5218F6YH22 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm5218F6YH22 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm5218F6YH22 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm5218F6YH22 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm5218F6YH22 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm5218F6YH22 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm5218F6YH22 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm5218F6YH22 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm5218F6YH22 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm5218F6YH22 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm5218F6YH22 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm5218F6YH22 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm5218F6YH22 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm5218F6YH22 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm5218F6YH22 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm5218F6YH22 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm5218F6YH22 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm5218F6YH22 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm5218F6YH22 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm5218F6YH22 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm5218F6YH22 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm5218F6YH22 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm5218F6YH22 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm5218F6YH22 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm5218F6YH22 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm5218F6YH22 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm5218F6YH22 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm5218F6YH22 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm5218F6YH22 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm5218F6YH22 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm5218F6YH22 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm5218F6YH22 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm5218F6YH22 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm5218F6YH22 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm5218F6YH22 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm5218F6YH22 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm5218F6YH22 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm5218F6YH22 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm5218F6YH22 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm5218F6YH22 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm5218F6YH22 Fbxo40-201ENSMUST00000075869 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm5218F6YH22 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm5218F6YH22 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm5218F6YH22 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm5218F6YH22 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm5218F6YH22 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm5218F6YH22 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm5218F6YH22 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm5218F6YH22 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm5218F6YH22 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm5218F6YH22 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm5218F6YH22 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm5218F6YH22 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm5218F6YH22 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm5218F6YH22 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms