Protein–RNA interactions for Protein: F6VAN0

Atf6, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-6 alpha, mousemouse

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Length 656 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf6F6VAN0 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Atf6F6VAN0 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Atf6F6VAN0 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Atf6F6VAN0 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Atf6F6VAN0 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Atf6F6VAN0 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Atf6F6VAN0 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Atf6F6VAN0 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Atf6F6VAN0 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Atf6F6VAN0 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Atf6F6VAN0 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Atf6F6VAN0 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Atf6F6VAN0 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Atf6F6VAN0 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Atf6F6VAN0 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Atf6F6VAN0 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Atf6F6VAN0 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Atf6F6VAN0 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Atf6F6VAN0 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Atf6F6VAN0 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Atf6F6VAN0 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Atf6F6VAN0 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Atf6F6VAN0 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Atf6F6VAN0 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Atf6F6VAN0 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Atf6F6VAN0 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Atf6F6VAN0 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Atf6F6VAN0 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Atf6F6VAN0 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Atf6F6VAN0 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Atf6F6VAN0 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Atf6F6VAN0 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Atf6F6VAN0 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Atf6F6VAN0 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Atf6F6VAN0 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Atf6F6VAN0 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Atf6F6VAN0 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Atf6F6VAN0 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Atf6F6VAN0 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Atf6F6VAN0 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Atf6F6VAN0 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Atf6F6VAN0 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Atf6F6VAN0 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Atf6F6VAN0 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Atf6F6VAN0 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Atf6F6VAN0 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Atf6F6VAN0 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Atf6F6VAN0 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Atf6F6VAN0 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Atf6F6VAN0 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Atf6F6VAN0 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Atf6F6VAN0 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Atf6F6VAN0 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Atf6F6VAN0 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Atf6F6VAN0 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Atf6F6VAN0 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Atf6F6VAN0 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Atf6F6VAN0 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Atf6F6VAN0 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Atf6F6VAN0 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Atf6F6VAN0 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Atf6F6VAN0 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Atf6F6VAN0 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Atf6F6VAN0 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Atf6F6VAN0 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Atf6F6VAN0 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Atf6F6VAN0 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Atf6F6VAN0 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Atf6F6VAN0 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Atf6F6VAN0 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Atf6F6VAN0 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Atf6F6VAN0 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Atf6F6VAN0 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Atf6F6VAN0 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Atf6F6VAN0 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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