Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9F7

Ccdc146, Coiled-coil domain-containing 146, mousemouse

Predictions only

Length 977 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc146E9Q9F7 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc146E9Q9F7 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc146E9Q9F7 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc146E9Q9F7 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc146E9Q9F7 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc146E9Q9F7 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc146E9Q9F7 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc146E9Q9F7 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc146E9Q9F7 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc146E9Q9F7 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc146E9Q9F7 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc146E9Q9F7 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc146E9Q9F7 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc146E9Q9F7 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc146E9Q9F7 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc146E9Q9F7 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc146E9Q9F7 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc146E9Q9F7 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc146E9Q9F7 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc146E9Q9F7 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc146E9Q9F7 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc146E9Q9F7 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc146E9Q9F7 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc146E9Q9F7 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc146E9Q9F7 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc146E9Q9F7 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc146E9Q9F7 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc146E9Q9F7 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc146E9Q9F7 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc146E9Q9F7 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc146E9Q9F7 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc146E9Q9F7 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc146E9Q9F7 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc146E9Q9F7 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc146E9Q9F7 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc146E9Q9F7 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc146E9Q9F7 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc146E9Q9F7 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc146E9Q9F7 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc146E9Q9F7 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc146E9Q9F7 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc146E9Q9F7 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc146E9Q9F7 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc146E9Q9F7 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc146E9Q9F7 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc146E9Q9F7 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc146E9Q9F7 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc146E9Q9F7 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc146E9Q9F7 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc146E9Q9F7 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc146E9Q9F7 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc146E9Q9F7 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc146E9Q9F7 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Ccdc146E9Q9F7 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Ccdc146E9Q9F7 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Ccdc146E9Q9F7 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc146E9Q9F7 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc146E9Q9F7 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc146E9Q9F7 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc146E9Q9F7 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc146E9Q9F7 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc146E9Q9F7 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc146E9Q9F7 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc146E9Q9F7 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc146E9Q9F7 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc146E9Q9F7 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc146E9Q9F7 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc146E9Q9F7 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc146E9Q9F7 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc146E9Q9F7 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc146E9Q9F7 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc146E9Q9F7 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc146E9Q9F7 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc146E9Q9F7 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc146E9Q9F7 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc146E9Q9F7 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc146E9Q9F7 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc146E9Q9F7 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc146E9Q9F7 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc146E9Q9F7 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc146E9Q9F7 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc146E9Q9F7 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc146E9Q9F7 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc146E9Q9F7 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc146E9Q9F7 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc146E9Q9F7 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc146E9Q9F7 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc146E9Q9F7 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc146E9Q9F7 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc146E9Q9F7 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc146E9Q9F7 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc146E9Q9F7 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc146E9Q9F7 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc146E9Q9F7 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc146E9Q9F7 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc146E9Q9F7 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc146E9Q9F7 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc146E9Q9F7 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc146E9Q9F7 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc146E9Q9F7 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms