Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5G2

Pcdhb9, Protocadherin beta 9, mousemouse

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdhb9E9Q5G2 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pcdhb9E9Q5G2 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pcdhb9E9Q5G2 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pcdhb9E9Q5G2 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pcdhb9E9Q5G2 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pcdhb9E9Q5G2 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pcdhb9E9Q5G2 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pcdhb9E9Q5G2 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pcdhb9E9Q5G2 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pcdhb9E9Q5G2 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pcdhb9E9Q5G2 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Pcdhb9E9Q5G2 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Pcdhb9E9Q5G2 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pcdhb9E9Q5G2 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pcdhb9E9Q5G2 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pcdhb9E9Q5G2 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Pcdhb9E9Q5G2 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pcdhb9E9Q5G2 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Pcdhb9E9Q5G2 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pcdhb9E9Q5G2 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pcdhb9E9Q5G2 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pcdhb9E9Q5G2 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pcdhb9E9Q5G2 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pcdhb9E9Q5G2 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pcdhb9E9Q5G2 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pcdhb9E9Q5G2 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pcdhb9E9Q5G2 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pcdhb9E9Q5G2 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pcdhb9E9Q5G2 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pcdhb9E9Q5G2 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pcdhb9E9Q5G2 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pcdhb9E9Q5G2 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pcdhb9E9Q5G2 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pcdhb9E9Q5G2 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pcdhb9E9Q5G2 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pcdhb9E9Q5G2 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pcdhb9E9Q5G2 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pcdhb9E9Q5G2 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pcdhb9E9Q5G2 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pcdhb9E9Q5G2 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pcdhb9E9Q5G2 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pcdhb9E9Q5G2 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pcdhb9E9Q5G2 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pcdhb9E9Q5G2 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pcdhb9E9Q5G2 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pcdhb9E9Q5G2 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pcdhb9E9Q5G2 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Pcdhb9E9Q5G2 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pcdhb9E9Q5G2 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pcdhb9E9Q5G2 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pcdhb9E9Q5G2 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pcdhb9E9Q5G2 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Pcdhb9E9Q5G2 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Pcdhb9E9Q5G2 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pcdhb9E9Q5G2 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pcdhb9E9Q5G2 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pcdhb9E9Q5G2 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pcdhb9E9Q5G2 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pcdhb9E9Q5G2 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pcdhb9E9Q5G2 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pcdhb9E9Q5G2 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pcdhb9E9Q5G2 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcdhb9E9Q5G2 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcdhb9E9Q5G2 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcdhb9E9Q5G2 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcdhb9E9Q5G2 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcdhb9E9Q5G2 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcdhb9E9Q5G2 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcdhb9E9Q5G2 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcdhb9E9Q5G2 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcdhb9E9Q5G2 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcdhb9E9Q5G2 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcdhb9E9Q5G2 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcdhb9E9Q5G2 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcdhb9E9Q5G2 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcdhb9E9Q5G2 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcdhb9E9Q5G2 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcdhb9E9Q5G2 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcdhb9E9Q5G2 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcdhb9E9Q5G2 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcdhb9E9Q5G2 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcdhb9E9Q5G2 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcdhb9E9Q5G2 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcdhb9E9Q5G2 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcdhb9E9Q5G2 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcdhb9E9Q5G2 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcdhb9E9Q5G2 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcdhb9E9Q5G2 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcdhb9E9Q5G2 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcdhb9E9Q5G2 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcdhb9E9Q5G2 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcdhb9E9Q5G2 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcdhb9E9Q5G2 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcdhb9E9Q5G2 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcdhb9E9Q5G2 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcdhb9E9Q5G2 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcdhb9E9Q5G2 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcdhb9E9Q5G2 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcdhb9E9Q5G2 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcdhb9E9Q5G2 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms